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本研究的主要作者包括Peng Cao、Fulong Ren、Chao Wan、Jinzhu Yang和Osmar Zaiane。研究机构包括中国东北大学的计算机科学与工程学院、中国东北大学的教育部医学图像计算重点实验室、中国医科大学第一附属医院眼科以及加拿大阿尔伯塔大学的计算机科学系。该研究发表于2018年的期刊《Computerized Medical Imaging and Graphics》。
糖尿病视网膜病变(Diabetic Retinopathy, DR)是糖尿病最严重的并发症之一,早期检测和治疗是减少视力丧失风险的关键公共卫生干预措施。传统的DR筛查系统依赖于微动脉瘤(Microaneurysms, MAs)和出血(Hemorrhages, Hs)病变的检测,但其高敏感性导致大量假阳性样本,且由于可疑病变缺乏标签信息,分类模型难以有效去除假阳性。因此,本研究旨在解决DR诊断中的监督学习问题,提出了一种基于弱监督和不平衡数据的多核多实例学习方法。
问题定义与多实例学习框架
研究将DR诊断问题定义为多实例学习(Multi-Instance Learning, MIL)问题,其中每张图像(包)被标记为健康或异常,包含未标记的候选病变区域(实例)。研究提出了一种基于图核的多核多实例学习方法,并通过实例级欠采样和包级过采样来提高DR诊断中的多实例学习性能。
实例生成与特征提取
研究使用了一种初步检测算法生成候选病变区域(ROIs),并从颜色、梯度、形状和纹理等多个方面提取了37个图像特征。这些特征用于表征每个候选病变区域。
实例级欠采样(BUS)
为了减少包内假阳性实例的影响,研究提出了一种实例级欠采样方法,通过过滤不相关实例来减少包内不平衡数据分布。该方法基于迁移学习和欠采样思想,通过估计源数据集和目标数据集之间的分布差异来优化实例权重。
图核构建与多核学习
研究将每个包映射为一个无向图,并使用图核来区分正负包。通过多核学习(Multiple Kernel Learning, MKL)框架,研究结合了多个基核函数,以捕获不同特征子集之间的关系,并构建非线性模型。
包级过采样(BOS)
针对包级数据不平衡问题,研究扩展了合成少数类过采样技术(SMOTE),生成合成包以平衡数据分布。该方法通过自适应权重分配策略,确保生成的合成实例更接近真实病变。
多核多实例分类器训练
研究使用多核学习框架训练分类器,通过优化核组合权重和分类器模型,实现对DR的准确诊断。实验结果表明,该方法在Messidor数据集上取得了优异的分类性能。
分类性能
研究在Messidor数据集上进行了广泛的实验,结果表明提出的多核多实例学习框架在DR诊断中表现优异,总体分类准确率为0.916,AUC为0.957。与基线方法和现有最先进方法相比,该方法在准确率、敏感性和特异性方面均有所提升。
特征子集权重分析
研究通过多核学习框架分析了不同特征子集的权重,发现红色通道的强度特征和Haralick纹理特征对分类性能贡献最大。
重采样参数的影响
研究还探讨了欠采样和过采样参数对分类性能的影响,发现当欠采样参数s=0.4、过采样参数m=150%时,分类性能达到最佳。
本研究提出了一种基于多核多实例学习的DR诊断框架,通过实例级欠采样和包级过采样解决了弱监督和不平衡数据问题。实验结果表明,该方法在DR诊断中具有较高的准确性和鲁棒性,能够有效减少假阳性样本并提高诊断性能。该研究为DR的自动化筛查提供了新的思路,具有重要的科学价值和应用前景。
多核多实例学习框架
研究首次将多核学习与多实例学习相结合,提出了一种新的DR诊断框架,能够有效处理弱监督和不平衡数据。
双层次重采样策略
研究提出了实例级欠采样和包级过采样的双层次重采样策略,显著提高了DR诊断的性能。
特征子集权重分析
通过多核学习框架,研究分析了不同特征子集的权重,为DR诊断提供了更深入的特征理解。
研究还探讨了稀疏图像表示与密集图像表示的优劣,发现基于候选病变区域的稀疏表示在DR诊断中更具优势。此外,研究还对比了深度学习方法,表明多核多实例学习在弱监督数据下的表现优于深度学习模型。
总体而言,本研究为DR的自动化筛查和诊断提供了新的方法,具有重要的理论和实践意义。