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BTK表达在肺腺癌中的生物信息学分析:对免疫浸润、预后标志物和治疗靶点的影响

期刊:3 biotechDOI:10.1007/s13205-024-04053-z

本文由Lijun Jiao、Yujian Tao、Huizhen Ding、Feng Wu、Yantong Liu、Chuang Li和Feifei Li共同撰写,发表于2024年8月28日的《3 Biotech》期刊上。该研究通过生物信息学分析,探讨了Bruton酪氨酸激酶(BTK)在肺腺癌(LUAD)中的表达及其对免疫浸润、预后标志物和治疗靶点的影响。

研究背景

肺腺癌是非小细胞肺癌(NSCLC)中最常见的亚型,占所有肺癌病例的约40%。尽管近年来免疫治疗在肺癌治疗中取得了显著进展,但患者的总体生存率仍然较低。肿瘤微环境(TME)在肿瘤进展和治疗反应中起着关键作用,而BTK作为一种主要在造血系统中表达的酪氨酸激酶,其在肺腺癌中的作用尚未得到充分研究。因此,本研究旨在通过生物信息学工具和公开数据库,分析BTK在肺腺癌中的表达及其对肿瘤进展和预后的影响。

研究方法

研究团队从癌症基因组图谱(TCGA)数据库中获取了513例肺腺癌患者的RNA测序数据和临床记录。根据BTK的表达水平,患者被分为高表达组和低表达组。研究使用了多种生物信息学工具,包括TIMER 2.0、GEPIA 2和人类蛋白质图谱(HPA),来分析BTK在肿瘤和正常组织中的mRNA和蛋白质表达。此外,研究还进行了基因组富集分析,以探索与BTK相关的生物学功能和通路。通过TIMER和CIBERSORT工具,研究团队进一步分析了BTK表达与肿瘤浸润免疫细胞之间的关系。

研究结果

  1. BTK表达与临床特征:研究发现,BTK在肺腺癌组织中的表达显著低于正常组织,且高表达BTK的患者多为女性,且处于较早的临床分期(T1、T2和AJCC I、II期)。
  2. 生存分析:高表达BTK的患者总体生存期显著延长,表明BTK可能是一个独立的预后标志物。
  3. 肿瘤突变负荷(TMB)分析:研究发现,BTK表达与TMB之间存在复杂的关系,高TMB水平通常与免疫治疗的更好反应相关。
  4. 基因表达差异分析:通过差异表达基因(DEG)分析,研究发现高表达BTK的基因主要与免疫调节相关,而低表达BTK的基因则与代谢通路相关。
  5. 免疫浸润分析:BTK高表达与多种免疫细胞(如CD8+ T细胞、CD4+ T细胞、B细胞、巨噬细胞和树突状细胞)的浸润增加相关,而调节性T细胞(Treg)和Th2细胞的比例则减少。
  6. 免疫检查点分析:BTK表达与多种免疫检查点(如PDCD1、CD274、CTLA4等)显著相关,提示BTK可能在免疫治疗中具有潜在的应用价值。

研究结论

研究表明,BTK在肺腺癌中的低表达与肿瘤进展相关,而高表达BTK的患者具有更好的预后。BTK通过调节免疫微环境中的免疫细胞浸润和免疫检查点表达,可能对肺腺癌的免疫治疗产生重要影响。因此,BTK不仅是一个潜在的预后标志物,还可能成为未来免疫治疗的靶点。

研究亮点

  1. 重要发现:BTK在肺腺癌中的表达与患者预后密切相关,高表达BTK的患者生存期显著延长。
  2. 方法创新:研究使用了多种生物信息学工具和数据库,结合基因组富集分析和免疫浸润分析,全面探讨了BTK在肺腺癌中的作用。
  3. 应用价值:BTK不仅是一个潜在的预后标志物,还可能通过调节免疫微环境影响免疫治疗的效果,为肺腺癌的个体化治疗提供了新的思路。

未来研究方向

尽管本研究揭示了BTK在肺腺癌中的重要作用,但其具体的分子机制仍需进一步研究。未来的研究可以通过实验验证BTK在肿瘤微环境中的具体作用,并探索其在其他类型癌症中的潜在应用。

资助与声明

本研究由扬州市重点学科培育计划(呼吸系统疾病,编号Yzyxzdxk-010)和群山国立大学科研基金(编号2023H052)资助。作者声明无利益冲突,研究方案已获得扬州大学附属医院伦理委员会的批准。

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