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作者及研究机构
本研究的主要作者包括Yifan Zhao、Shubin Chen、Xiaobo Liu等,他们分别来自广州医科大学第五附属医院先进跨学科医学创新中心、中国科学院香港科学与创新研究院再生医学与健康中心、吉林大学第一医院癌症精准医学实验室等多个机构。该研究发表于期刊《Cell Proliferation》,发表日期为2024年。
学术背景
牙齿再生是一种恢复缺失或受损牙齿功能和美观的潜在策略。牙齿的发育源于口腔上皮细胞与来自颅神经嵴(cranial neural crest, CNC)的间充质细胞之间的相互作用。颅神经嵴细胞(CNCCs)被认为是牙齿修复和再生的有前途的间充质细胞来源。然而,体外培养的CNCCs在牙齿发生过程中的细胞异质性和分化路径尚不清楚。本研究旨在通过单细胞RNA测序(single-cell RNA sequencing, scRNA-seq)技术,揭示体外培养的CNCCs在牙齿发生过程中的细胞异质性和分化轨迹,并探索其作为牙齿再生细胞来源的潜力。
研究流程
研究流程包括以下几个主要步骤:
1. 细胞分离与培养:从胚胎第9.5天(E9.5)的小鼠胚胎中分离颅神经嵴和躯干神经嵴(trunk neural crest, TNC)细胞,并在体外培养至第5代(P5)。培养条件包括使用Matrigel包被的培养板和含有N2、B27、bFGF、EGF的DMEM/F12培养基。
2. 单细胞RNA测序:对P0、P3和P5阶段的CNCCs进行单细胞RNA测序,使用10x Genomics平台进行分析,共检测了超过59,000个细胞。数据预处理使用CellRanger流程,下游分析使用Scanpy软件包。
3. 免疫荧光与组织学分析:通过免疫荧光染色检测细胞标志物(如p75、Sox2、Pax3等),并通过H&E染色分析再生牙齿样结构的组织学特征。
4. 牙齿再生实验:将体外培养的CNCCs和TNCCs与E14.5-E16.5小鼠牙胚的上皮细胞重组,移植到小鼠肾包膜下,观察牙齿样结构的形成。
5. 基因表达与调控网络分析:通过RNA测序和基因调控网络(gene regulatory network, GRN)分析,鉴定牙齿形成过程中关键基因的表达模式和调控机制。
主要结果
1. 单细胞RNA测序揭示CNCCs的异质性:在P0阶段的CNCCs中鉴定出10种细胞类型,包括ALX3+/BARX1+细胞亚群,这一亚群具有牙齿发生的潜力。
2. 体外培养CNCCs的分化轨迹:在P3和P5阶段,CNCCs分化为神经和骨/牙齿发生两条主要路径,并鉴定出两个牙齿发生细胞亚群(BARX1+和BARX1-)。
3. 牙齿样结构的成功诱导:体外培养的CNCCs和TNCCs在与牙胚上皮细胞重组后,成功诱导出包含牙釉质、牙本质和牙髓的牙齿样结构,诱导率分别为26.7%和22.1%。
4. 关键基因与调控网络:细胞周期、DNA复制和Wnt信号通路基因在牙齿形成过程中显著上调,PRRX1和TFAP2B基因调控网络在牙齿发生分化中起关键作用。
5. EMCN标记的牙齿发生细胞:EMCN标记的细胞在牙齿诱导实验中表现出更高的成功率,证实了其在牙齿再生中的重要性。
结论
本研究首次通过单细胞RNA测序技术揭示了体外培养的CNCCs在牙齿发生过程中的细胞异质性和分化轨迹,并成功诱导出完整的牙齿样结构。研究结果表明,CNCCs和TNCCs具有牙齿再生的潜力,特别是ALX3+/BARX1+细胞亚群和EMCN标记的细胞在牙齿再生中发挥重要作用。这些发现为牙齿再生研究提供了新的细胞来源和分子机制基础,具有重要的科学和应用价值。
研究亮点
1. 单细胞分辨率下的细胞异质性分析:通过大规模单细胞RNA测序,首次详细揭示了体外培养的CNCCs在牙齿发生过程中的细胞异质性和分化轨迹。
2. 成功诱导完整的牙齿样结构:首次在体外培养的CNCCs和TNCCs中成功诱导出包含牙釉质、牙本质和牙髓的牙齿样结构。
3. 关键基因与调控网络的鉴定:揭示了细胞周期、DNA复制和Wnt信号通路在牙齿形成中的关键作用,并鉴定了PRRX1和TFAP2B基因调控网络。
4. EMCN标记的牙齿发生细胞:首次发现EMCN标记的细胞在牙齿再生中的重要作用,为牙齿再生研究提供了新的细胞标记物。
其他有价值的内容
本研究还通过RNA测序和基因调控网络分析,揭示了牙齿形成过程中关键基因的表达模式和调控机制,为未来研究提供了重要的分子机制基础。此外,研究还发现TNCCs具有牙齿再生的潜力,这为牙齿再生研究提供了新的细胞来源。
以上是对该研究的全面介绍,涵盖了研究的背景、流程、结果、结论及亮点,旨在为其他研究者提供详细的参考。