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慢病毒共递送Cas9 mRNA和靶向VEGFA的引导RNA预防小鼠湿性年龄相关性黄斑变性的研究

期刊:Nature Biomedical EngineeringDOI:10.1038/s41551-020-00656-y

类型a

Sikai Ling, Shiqi Yang, Xinde Hu 等人来自上海交通大学、中国科学院神经科学研究所、复旦大学等机构,于2020年在《Nature Biomedical Engineering》上发表了这项研究。

该研究的主要科学领域是基因编辑和治疗性基因组编辑。CRISPR 是一种强大的基因组编辑工具,具有治愈遗传疾病、获得性疾病和传染病的潜力。然而,CRISPR 核酸酶和引导 RNA(gRNA)的有效靶向递送仍然是基因治疗应用中的关键瓶颈。本研究旨在开发一种有效且安全的基因编辑方法,通过使用改良的慢病毒载体来递送 Cas9 mRNA 和 gRNA,从而避免长期表达 Cas9 所带来的脱靶效应和抗 Cas9 免疫反应。

本研究包括多个实验步骤:

  1. 构建了一个高效的 mRNA 递送慢病毒系统:通过模仿 HIV-1 封装其 RNA 的机制,研究人员将 MS2 外壳蛋白(MS2C)融合到慢病毒 Gag-Pol 蛋白的 N 端或 C 端,并在目标 mRNA 上插入 MS2 干环(stem loop)。他们比较了不同修饰对 GFP mRNA 递送效率的影响,发现 N 端单体 MS2C 融合修饰的 Gag-Pol 最有效。
  2. 测试了 MLV-Cas9 的时间限制性核酸酶暴露基因组编辑能力:研究人员将 Cas9 插入 CMV 启动子和干环之间,然后在自失活的第三代慢病毒 3′ 长末端重复区(LTR)中插入 U6-gRNA 表达盒。通过逆转录过程,gRNA 序列被复制到 5′ LTR 中,每个病毒 episome 因此有两个 gRNA 表达盒副本。
  3. 开发了一种全合一的 MLV-CRISPR 系统:通过整合 MLV-Cas9 和 IDLV-gRNA 系统,研究人员生产了全合一的 CRISPR 慢病毒颗粒(MLV-CRISPR),并验证了其在不同细胞系中的基因编辑效率。他们还优化了 gRNA 骨架,显著提高了基因编辑效率。
  4. 在体内测试了 MLV-CRISPR 对视网膜色素上皮(RPE)细胞的特异性靶向能力:通过视网膜下注射,研究人员评估了 MLV-CRISPR 在小鼠模型中的生物分布和基因编辑效果。他们还进行了激光诱导的脉络膜新生血管(CNV)实验,以评估其治疗湿性年龄相关性黄斑变性(wAMD)的效果。

主要结果如下:

  1. 高效递送系统:N 端单体 MS2C 融合修饰的 Gag-Pol 显示出最高的 GFP mRNA 递送效率。与传统的慢病毒载体相比,MLP-GFP 在未饱和条件下表现出更高的转导效率。
  2. 时间限制性核酸酶暴露:MLV-Cas9 在体内仅在 VSV-G 存在的情况下诱导 indels,表明 Cas9 mRNA 传递依赖于 VSV-G 介导的内吞作用。与 Lenti-Cas9 相比,MLV-Cas9 的基因编辑效率在短期内略低,但在长时间内保持稳定。
  3. 全合一 MLV-CRISPR 提高基因编辑效率:全合一 MLV-CRISPR 系统在不同剂量下始终比分离系统更高效。与 Lenti-CRISPR 相比,MLV-CRISPR 在低剂量下仍表现出强大的基因编辑能力,且脱靶效应更低。
  4. 体内靶向 RPE 细胞:视网膜下注射后,MLV-CRISPR 几乎完全转导了单细胞 RPE 层,显示出高度的 RPE 特异性。qPCR 分析显示,注射眼的病毒基因组拷贝数显著高于未注射眼。
  5. 体内 VEGFA 基因敲除:单次注射 MLV-CRISPR 后,RPE 细胞中观察到 13% 的 indel 形成,且未检测到脱靶切割。VEGFA 水平显著下调,表明实际基因编辑在 RPE 细胞中应更高。
  6. 预防 CNV:在激光诱导的 wAMD 小鼠模型中,MLV-CRISPR 显著减少了 CNV 面积,降低了 63%,且未引发显著的先天性和适应性免疫反应。

结论表明,MLV-CRISPR 系统能够有效且特异性地靶向 RPE 细胞,通过瞬时核酸酶暴露使用 Cas9 mRNA 进行体内基因编辑,而不会引发显著的先天性和适应性免疫反应。这项研究为视网膜新生血管疾病的治疗提供了新的基础。

研究亮点包括: 1. 重要发现:MLV-CRISPR 系统在体内显著减少了 CNV 面积,降低了 63%,且未引发显著的先天性和适应性免疫反应。 2. 新颖方法:通过模仿 HIV-1 封装其 RNA 的机制,研究人员开发了一种高效的 mRNA 递送慢病毒系统。 3. 特殊研究对象:研究专注于视网膜色素上皮(RPE)细胞,这些细胞是成人眼睛后部唯一的 VEGFA 来源。

其他有价值的内容包括:MLV-CRISPR 系统可以扩展到递送编码其他类型 Cas9 核酸酶、碱基编辑器、主编辑器和表观基因组编辑器的 mRNA。此外,初步数据显示,慢病毒颗粒还可以递送 ABE-max,在两个不同位点的效率分别超过 31% 和 63%。

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