这篇文档属于类型a，即报告了一项原创性研究。以下是针对该研究的学术报告：
该研究的主要作者包括Jose Norberto S. Vargas、Chunxin Wang、Eric Bunker等，研究团队来自美国国立卫生研究院（National Institutes of Health）、英国医学研究委员会分子生物学实验室（MRC Laboratory of Molecular Biology）以及伦敦大学学院（University College London）等机构。研究于2019年4月18日发表在期刊《Molecular Cell》上。
该研究的主要科学领域是细胞自噬（autophagy），特别是选择性自噬（selective autophagy）的机制。选择性自噬是细胞通过自噬体（autophagosome）选择性降解受损细胞器或入侵病原体的过程，以维持细胞内稳态。尽管自噬的基本机制已被广泛研究，但选择性自噬中ULK1复合物的靶向和激活机制仍不清楚。ULK1复合物是自噬体形成的最上游调控因子，其激活通常依赖于能量感应通路（如AMPK和mTOR）。然而，在选择性自噬中，ULK1如何被激活并定位到特定货物（cargo）上仍是一个未解之谜。本研究旨在揭示NDP52和TBK1在选择性自噬中调控ULK1复合物激活的时空机制。
研究主要包括以下几个步骤：
NDP52介导的线粒体自噬：研究团队使用化学诱导二聚化（CID）实验，将NDP52直接招募到线粒体上，以模拟选择性自噬的启动。通过荧光成像和流式细胞术（FACS）分析，研究团队观察到NDP52的线粒体定位能够诱导自噬体的形成，并招募FIP200、ATG14和ATG16L1等自噬相关蛋白。
NDP52与ULK1复合物的相互作用：通过免疫共沉淀实验，研究团队发现NDP52通过FIP200与ULK1复合物结合，并且这种结合在TBK1的促进下增强。进一步的功能分析表明，NDP52的SKICH结构域是其与FIP200结合的关键区域。
ULK1的货物定位与激活：研究团队通过CID实验将ULK1直接招募到线粒体上，发现ULK1的激活独立于AMPK和mTOR信号通路。ULK1的T180位点是其自磷酸化的关键位点，突变该位点会抑制自噬体的形成。
TBK1在自噬中的作用：研究团队发现TBK1通过促进NDP52与FIP200的结合来调控ULK1复合物的招募。此外，TBK1的线粒体定位能够诱导自噬体的形成，但其活性依赖于其激酶功能。
过氧化物酶体自噬：研究团队进一步验证了NDP52和ULK1在过氧化物酶体自噬（pexophagy）中的作用，发现其机制与线粒体自噬类似。
NDP52通过FIP200与ULK1复合物结合：免疫共沉淀实验表明，NDP52在TBK1的促进下与ULK1复合物结合，并且这种结合在自噬过程中增强。
ULK1的激活独立于AMPK和mTOR：通过CID实验，研究团队发现ULK1的激活依赖于其在货物上的定位，而不依赖于能量感应通路。ULK1的T180位点突变会抑制自噬体的形成。
TBK1调控NDP52与ULK1复合物的结合：TBK1通过促进NDP52与FIP200的结合来调控ULK1复合物的招募。TBK1的线粒体定位能够诱导自噬体的形成，但其活性依赖于其激酶功能。
NDP52和ULK1在过氧化物酶体自噬中的作用：研究团队发现NDP52和ULK1的过氧化物酶体定位能够诱导过氧化物酶体的降解，进一步验证了其在选择性自噬中的普适性。
该研究揭示了NDP52和TBK1在选择性自噬中调控ULK1复合物激活的时空机制。研究发现，NDP52通过FIP200与ULK1复合物结合，并在TBK1的促进下将其招募到货物上，从而启动自噬体的形成。ULK1的激活独立于AMPK和mTOR信号通路，而是依赖于其在货物上的定位。这一发现为选择性自噬的机制提供了新的见解，并揭示了ULK1复合物在自噬体形成中的关键作用。
该研究不仅阐明了NDP52和TBK1在选择性自噬中的具体作用机制，还为理解自噬体的形成提供了新的视角。研究结果表明，ULK1的激活可以通过其在货物上的定位来实现，而不依赖于传统的能量感应通路。这一发现为开发针对自噬相关疾病的治疗策略提供了潜在的理论基础。
研究团队还开发了一种嵌合体Parkin蛋白，该蛋白能够结合FIP200，从而绕过NDP52和TBK1的功能缺陷，进一步验证了NDP52和TBK1在选择性自噬中的作用。这一结果为理解自噬体的形成机制提供了新的实验工具。