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子宫内膜癌肿瘤微环境中免疫景观的预后意义

期刊:Journal of Cellular and Molecular MedicineDOI:10.1111/jcmm.15408

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研究的主要作者和单位
本研究由Li Bi-Lan和Wan Xiao-Ping共同完成,作者单位是上海第一妇婴保健院及同济大学医学院妇产科。研究发表在2020年的Journal of Cellular and Molecular Medicine (J Cell Mol Med)上。

学术背景
子宫内膜癌(Endometrial Cancer, EC)是全球女性常见的恶性肿瘤之一,其发病率和死亡率较高。尽管目前已有多种治疗方法(如手术、放疗、化疗等),但由于肿瘤的高度异质性,现有风险评估系统在预测患者预后方面存在不足。肿瘤微环境(Tumor Microenvironment, TME)在肿瘤发生、发展和转移中起着关键作用,尤其是免疫微环境的特征与患者预后密切相关。然而,子宫内膜癌的免疫微环境特征及其与患者预后的关系尚未被系统研究。因此,本研究旨在通过对The Cancer Genome Atlas (TCGA)数据库中子宫内膜癌样本的分析,揭示子宫内膜癌免疫微环境的异质性,并探讨其与患者预后的关联。

研究流程
研究主要包括以下步骤:
1. 数据获取与预处理
研究使用了TCGA数据库中子宫体子宫内膜癌(Uterine Corpus Endometrial Carcinoma, UCEC)队列的RNA测序数据和DNA甲基化数据,共包含538个样本。数据经过归一化处理,并移除了AML样本。
2. 免疫特征聚类
通过对83个基因表达特征的分析,研究使用GSVA(Gene Set Variation Analysis)方法将样本分为四个免疫亚型:C1(免疫抑制型)、C2(IFN-γ主导型)、C3(炎症型)和C4(免疫平衡型)。每个亚型的免疫细胞特征和免疫调节分子(Immunomodulators, IMs)表达模式被详细分析。
3. 肿瘤免疫浸润成分分析
研究进一步分析了不同免疫亚型中肿瘤浸润免疫细胞的组成,包括自然杀伤T细胞(NKT)、树突状细胞(DCs)、CD8+ T细胞等。通过ESTIMATE方法评估了肿瘤组织中的基质和免疫细胞评分。
4. 预后意义分析
研究通过Kaplan-Meier曲线和Cox比例风险模型分析了不同免疫亚型与患者总体生存率(Overall Survival, OS)的关系,并计算了各免疫细胞类型的C指数(Concordance Index, C-index)。
5. 免疫调节分子表达与DNA甲基化的关系
研究分析了免疫调节分子表达与DNA甲基化的相关性,检测了583个样本的甲基化数据,并使用了Illumina HumanMethylation450k芯片进行分析。
6. B细胞受体(BCR)和T细胞受体(TCR)多样性分析
研究通过RNA测序数据评估了不同免疫亚型中BCR和TCR的多样性,分别计算了物种丰富度和Shannon熵。

主要结果
1. 免疫亚型的划分及其特征
研究将子宫内膜癌样本分为四个免疫亚型:C1(免疫抑制型)具有最低的免疫活性,C2(IFN-γ主导型)表现出较高的IFN-γ和淋巴细胞浸润,C3(炎症型)具有最强的免疫活性,C4(免疫平衡型)则表现出免疫细胞的平衡分布。
2. 免疫细胞浸润与预后关联
C3亚型患者预后最好,而C1亚型患者预后最差。自然杀伤T细胞(NKT)、树突状细胞(DCs)和CD8+ T细胞与患者生存率显著相关。
3. 免疫调节分子与DNA甲基化的关系
许多免疫调节分子的表达与DNA甲基化水平呈负相关,例如CD28、LAG3、CTLA4、PDL2和VTCN1。
4. BCR和TCR多样性
不同免疫亚型的BCR和TCR多样性存在显著差异。

结论
本研究通过系统地分析子宫内膜癌的免疫微环境,将其划分为四个具有显著异质性的免疫亚型,并揭示了这些亚型与患者预后的密切关联。研究结果表明,免疫细胞浸润特征和免疫调节分子表达可以作为子宫内膜癌分类和预后评估的新指标。此外,DNA甲基化在调控免疫微环境中发挥了重要作用。这些发现为子宫内膜癌的免疫治疗策略提供了重要的理论依据,并为开发新的诊断标志物和治疗靶点奠定了基础。

研究亮点
1. 首次将子宫内膜癌划分为四个免疫亚型,揭示了其免疫微环境的异质性。
2. 明确了不同免疫亚型与患者预后的关联,特别是C3亚型患者预后最佳。
3. 发现了免疫调节分子表达与DNA甲基化之间的负相关关系。
4. 提供了子宫内膜癌免疫微环境的全面分析框架,为未来的免疫治疗研究提供了重要参考。

其他有价值的内容
本研究还探讨了不同肿瘤分期中免疫细胞的变化,发现巨噬细胞M1、M2和T细胞亚群在肿瘤进展中的显著变化。此外,研究通过BCR和TCR多样性分析,进一步揭示了免疫微环境的复杂性。


以上是本研究的主要内容及其学术价值的详细介绍。

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