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合成生物学:T细胞电路感知抗原密度的超灵敏阈值

期刊:ScienceDOI:10.1126/science.abc6273

这篇文档属于类型a,即报告了一项原创性研究。以下是针对该研究的学术报告:


主要作者及研究机构
本研究由Rogelio A. Hernandez-Lopez、Wei Yu、Katelyn A. Cabral、Olivia A. Creasey、Maria del Pilar Lopez Pazmino、Yurie Tonai、Arsenia de Guzman、Anna Mäkelä、Kalle Saksela、Zev J. Gartner和Wendell A. Lim共同完成。研究团队来自多个机构,包括加州大学旧金山分校(University of California San Francisco)的细胞设计研究所、细胞构建中心、药物化学系,以及赫尔辛基大学(University of Helsinki)的病毒学系。研究于2021年3月12日发表在《Science》期刊上。

学术背景
本研究属于合成生物学(synthetic biology)和免疫治疗领域。CAR-T细胞(嵌合抗原受体T细胞,Chimeric Antigen Receptor T cells)在治疗血液系统癌症方面取得了显著成功,但在治疗实体瘤时面临重大挑战,主要原因是CAR-T细胞难以区分肿瘤细胞和正常细胞。许多肿瘤相关抗原(如EGFR和HER2)在肿瘤细胞中过度表达,但在正常组织中也有低水平表达,这导致CAR-T细胞可能对正常组织产生毒性反应。为了解决这一问题,研究团队受天然超敏感反应电路的启发,设计了一种两步正反馈电路,使T细胞能够基于抗原密度的S形阈值区分目标细胞。

研究流程
研究分为多个步骤,详细流程如下:

  1. 电路设计
    研究团队设计了一种两步正反馈电路,其中低亲和力的合成Notch受体(synthetic Notch receptor, synNotch)控制高亲和力CAR的表达。具体来说,低亲和力的synNotch受体用于检测HER2抗原,当抗原密度达到一定阈值时,synNotch受体激活并诱导高亲和力CAR的表达。这种设计使得T细胞能够对高抗原密度的肿瘤细胞产生强烈的杀伤反应,而对低抗原密度的正常细胞保持低反应。

  2. 细胞系构建
    为了评估电路的性能,研究团队构建了一系列稳定表达不同HER2密度的K562白血病细胞系,这些细胞系的HER2表达量跨越了100倍的范围。这些细胞系的HER2密度与多种癌症细胞系的表达水平相对应。

  3. T细胞工程化
    研究团队在人类原代CD8+ T细胞中构建并测试了多种版本的抗HER2 synNotch→抗HER2 CAR电路。通过定量流式细胞术测量目标细胞的杀伤效果,评估电路的抗原密度敏感性。

  4. 体外实验
    在体外实验中,研究团队将工程化的T细胞与不同HER2密度的目标细胞共培养,测量T细胞的杀伤效果和增殖情况。结果显示,电路T细胞表现出显著的抗原密度超敏感性,能够清晰区分高密度和低密度的HER2表达细胞。

  5. 三维培养模型实验
    为了模拟更复杂的多细胞环境,研究团队使用了三维(3D)靶向球体培养模型。他们将低HER2和高HER2表达的MCF10A细胞组装成3D球体,并将其与工程化的T细胞共培养。通过3D共聚焦显微镜和半胱天冬酶活性染料,量化了目标细胞的杀伤效果。

  6. 小鼠肿瘤模型实验
    研究团队在多个小鼠肿瘤模型中评估了synNotch→CAR电路T细胞的密度区分能力。他们将高HER2和低HER2密度的肿瘤细胞分别植入小鼠的两侧,然后注射工程化的T细胞。结果显示,电路T细胞能够有效清除高HER2密度的肿瘤,而对低HER2密度的肿瘤几乎没有影响。

主要结果
1. 体外实验结果
电路T细胞表现出显著的抗原密度超敏感性,能够清晰区分高密度和低密度的HER2表达细胞。与组成性表达CAR的T细胞相比,电路T细胞对低密度抗原细胞的杀伤效果显著降低。

  1. 三维培养模型实验结果
    在3D培养模型中,电路T细胞能够有效侵入并杀伤高HER2密度的球体,但对低HER2密度的球体几乎没有影响。这表明电路T细胞在复杂多细胞环境中仍能保持高度的抗原密度区分能力。

  2. 小鼠肿瘤模型实验结果
    在小鼠肿瘤模型中,电路T细胞能够有效清除高HER2密度的肿瘤,而对低HER2密度的肿瘤几乎没有影响。这表明电路T细胞在体内仍能保持高度的抗原密度区分能力。

结论
本研究通过设计一种两步正反馈电路,成功实现了T细胞对抗原密度的超敏感区分。这种设计不仅提高了CAR-T细胞对肿瘤细胞的特异性,还显著降低了对正常组织的毒性反应。该研究为扩展CAR-T细胞在实体瘤治疗中的应用提供了新的思路,并展示了合成生物学在免疫治疗中的巨大潜力。

研究亮点
1. 重要发现
研究团队首次设计了一种能够基于抗原密度区分肿瘤细胞和正常细胞的T细胞电路,显著提高了CAR-T细胞的特异性。

  1. 方法创新
    研究团队开发了一种新型的两步正反馈电路,通过低亲和力synNotch受体和高亲和力CAR的结合,实现了T细胞的超敏感抗原密度区分。

  2. 研究对象的特殊性
    研究团队构建了多种HER2表达水平的细胞系和3D培养模型,全面评估了电路T细胞在不同环境中的性能。

其他有价值的内容
研究团队还展示了该电路在其他抗原(如EGFR)中的应用潜力,表明这种设计原则可以扩展到其他肿瘤相关抗原,进一步拓宽了CAR-T细胞的应用范围。


这篇报告详细介绍了研究的背景、流程、结果和结论,并突出了其科学价值和应用前景。

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