通过基因型表示图实现生物样本库规模数据的高效分析
基于Genotype Representation Graph (GRG)的研究:提升生物数据分析效率的新框架 学术背景与研究动机 随着测序技术的迅速进步,大规模基因组数据的收集变得愈发普遍,尤其是在人类疾病关联研究领域,基因组数据的分析需求日益增长。2023年底,英国生物银行(UK Biobank)在其云计算平台上发布了约50万份全基因组数据,其中已有20万份完成相位(phased)处理。这类庞大的数据集为科研提供了前所未有的机会,但也带来了新的难题:如何高效地编码和分析如此巨大的基因组数据?传统的二维表格化数据结构(如VCF文件格式)在储存和计算效率方面面临瓶颈,难以应对不断增长的数据需求。 在这一背景下,科学家们提出了新的数据表示和处理方法以优化压缩率和计算性能。本研究的目标是开发一种...