ACImpute:基于约束增强平滑方法的单细胞RNA测序数据插补

单细胞RNA测序(single-cell RNA sequencing, scRNA-seq)技术近年来在生物学和医学研究中得到了广泛应用,它能够揭示单个细胞的转录组信息,从而帮助科学家更好地理解细胞的异质性和复杂性。然而,scRNA-seq数据中存在一个普遍的问题,即“dropout事件”(dropout events)。这些事件导致许多基因在单个细胞中的表达值被记录为零,而这些零值可能分为两类:一类是“生物零”(biological zeros),表示基因在该细胞中确实没有表达;另一类是“技术零”(technical zeros),由于测序技术的限制导致基因表达未被检测到。这种数据稀疏性严重影响了后续分析的准确性和有效性,例如细胞聚类和轨迹推断。 为了解决这一问题,研究人员开发了多种插补...