基于尺度空间显著性的Hi-C数据分析方法

在基因组学领域,理解基因组的空间组织对于揭示基因调控机制至关重要。Hi-C技术作为一种全基因组染色体构象捕获技术,能够揭示基因组的三维结构,特别是染色质环(chromatin loops)在基因调控中的关键作用。然而,现有的Hi-C数据分析方法通常只能识别共享的染色质环,而难以检测细胞类型特异性的染色质环。这限制了我们对不同细胞类型中基因调控机制的理解。为了解决这一问题,Rui Liu等人提出了一种新的算法——SSSHiC(Significance in Scale Space for Hi-C Data),旨在通过尺度空间分析来识别细胞类型特异性的染色质环,从而更好地理解基因调控的细胞特异性。 论文来源 这篇论文由Rui Liu、Zhengwu Zhang、Hyejung Won和J. S...