FlowPacker: トーショナルフローマッチングを用いたタンパク質側鎖パッキング
タンパク質の三次元構造はそのアミノ酸配列によって決定され、タンパク質の機能はその三次元構造に大きく依存しています。タンパク質の側鎖構造(side-chain conformations)は、タンパク質の折り畳み、タンパク質-タンパク質相互作用、およびタンパク質設計(de novo protein design)において重要な役割を果たします。正確にタンパク質側鎖の構造を予測することは、タンパク質の折り畳みメカニズムを理解し、新しいタンパク質を設計し、タンパク質相互作用を研究するための鍵となります。しかし、従来の物理ベースのモデル(physics-based modeling)は、経験的なスコアリング関数(empirical scoring functions)、離散的なロタマーライブラリ(d...