基于自校正多标签学习的质粒宿主范围预测模型

质粒(plasmid)是细菌中独立于染色体DNA的小型环状双链DNA分子,它们通过水平基因转移(horizontal gene transfer)帮助宿主细菌获得抗生素抗性、金属抗性等有益特性。一些质粒能够在多种微生物中转移、复制或持续存在,这类质粒被称为广宿主范围质粒(broad-host-range plasmids, BHR plasmids)。准确预测BHR质粒的宿主范围对于理解质粒如何促进细菌进化、传播抗性基因以及开发重组载体具有重要意义。然而,目前缺乏提供BHR质粒详细宿主范围标签的数据库,这使得基于机器学习模型的宿主范围预测面临挑战。由于缺乏足够的标注样本,模型难以提取有效的特征表示,导致预测精度受限。 为了解决这一问题,香港城市大学电气工程系的Wei Zou、Yongxin ...