人工动态RNA结构集合引导的通用RNA适配体传感标签的理性设计

人工动态RNA结构集合引导的通用RNA适配体传感标签的理性设计 学术背景 RNA分子在自然和合成生物系统中扮演着多种角色,其功能强烈依赖于其动态和特定的三维结构。RNA的二级和三级结构,如发夹、伪结、多路连接等,是理解RNA功能的关键“构建模块”。然而,现有的RNA结构研究大多基于静态结构,而大多数RNA介导的过程涉及构象变化。因此,动态结构集合的描述能够捕捉RNA的进化保守模式,并有助于其扩展设计。近年来,荧光RNA适配体(fluorogenic RNA aptamer, FRAPT)在生物应用中取得了显著进展,但其设计缺乏对动态结构集合的深入理解,且缺乏通用的设计原则。为了克服这些限制,研究者们开发了一种人工动态RNA结构集合“SSPepper”,并基于此设计了一种通用的荧光RNA生物传...