利用AlphaFold高通量发现抑制性蛋白质片段的研究
高精度预测蛋白片段抑制活性的新方法:FragFold的应用 学术背景 蛋白质相互作用在细胞生命活动中扮演着至关重要的角色,而小肽(peptides)或蛋白片段(protein fragments)可以通过与特定蛋白界面结合,调节蛋白功能,甚至作为抑制剂发挥作用。近年来,高通量实验技术的发展使得在活细胞中大规模测量蛋白片段的抑制活性成为可能。然而,迄今为止,尚未有相应的计算方法能够预测哪些蛋白片段能够与目标蛋白结合并发挥抑制作用,更不用说预测它们的结合模式。这一领域的研究空白促使研究人员开发新的计算工具来解决这一问题。 AlphaFold的推出为蛋白质结构预测带来了革命性的突破,但其在预测蛋白片段与全蛋白结合方面的应用仍然有限。为了填补这一空白,Andrew Savinov等研究人员开发了一种...