AlphaFoldアプリケーションの統計的正しい評価のための定期的に更新されるベンチマークセット
タンパク質構造予測の新時代を切り拓く学術的背景 タンパク質構造の解析は、分子生物学および生命科学分野の中心的課題の一つです。従来の実験手法であるX線結晶構造解析、核磁気共鳴(NMR)、クライオ電子顕微鏡は、タンパク質の三次元構造研究に確かな基盤をもたらしてきましたが、試料作成の煩雑さや時間コストの高さ、そしてタンパク質の種類による適用範囲の限界により、全プロテオーム(蛋白質群)を広く網羅することは困難でした。2020年にDeepMindが開発したAlphaFold2(AF2)システムの登場以降、タンパク質構造予測分野は画期的な進展を迎えます。AlphaFold2はディープラーニングの手法を用いることで、ほぼ全ての既知のタンパク質配列の高品質な構造予測を実現し、構造網羅率を大きく拡張、生物医学...