大规模基因组测序研究中的高效存储与回归计算

随着大规模人口生物样本库的日益普及,全基因组测序(Whole Genome Sequencing, WGS)数据在人类健康和疾病研究中的潜力得到了显著提升。然而,WGS数据的庞大计算和存储需求给研究机构,尤其是资金不足的机构或发展中国家的研究人员带来了巨大挑战。这种资源分配的不平等限制了前沿遗传学研究的公平性。为了解决这一问题,Manuel A. Rivas和Christopher Chang等人开发了新的算法和回归方法,显著减少了WGS研究的计算时间和存储需求,特别是针对罕见变异的处理。 论文来源 这篇论文由Manuel A. Rivas和Christopher Chang共同撰写。Rivas来自斯坦福大学生物医学数据科学系,Chang则供职于Grail Inc.。该论文于2025年2月1...

复杂量化最小误差熵与基准点:理论及模型回归中的应用

复杂量化最小误差熵与基准点的理论及应用:模型回归中的突破 学术背景 在机器学习和信号处理领域,非高斯噪声的存在往往会对模型的性能产生不利影响。传统的均方误差(Mean Squared Error, MSE)虽然在理论上和计算上具有简单性,但在面对非高斯噪声时,其可靠性受到严重挑战。为了解决这一问题,研究者们提出了多种优化准则,其中最小误差熵(Minimum Error Entropy, MEE)因其在抑制脉冲噪声和异常值方面的优异表现而备受关注。然而,原始的MEE算法由于需要对误差样本进行双重求和,计算复杂度较高,限制了其在大规模数据集中的应用。 为了降低计算负担,Zheng等人提出了量化最小误差熵(Quantized MEE, QMEE),通过量化技术显著提高了计算效率。在此基础上,本研究...