MAEST:基于图掩码自编码器的空间转录组学中的精确空间域检测
空间转录组学——解析组织空间异质性的前沿技术 空间转录组学(Spatial Transcriptomics, ST)是一项近年来蓬勃发展的测序技术,其核心在于能够在组织切片层面,兼顾基因表达与空间位置信息,为揭示多细胞生物组织的空间结构、功能分区及疾病微环境提供了前所未有的数据基础。随着10x Visium、Slide-seq、Stereo-seq、seqFISH和MERFISH等平台技术的逐步成熟,科学家得以获得高分辨率、空间可追溯的大规模基因表达数据,极大推动了发育生物学、神经科学及肿瘤生物学等领域的进步。 空间结构域识别(Spatial Domain Identification)则是空间转录组数据分析中的核心环节。其目标是将表达模式相近、地理位置相邻的细胞点(Spot)分为具有生物学...