使用长范围PCR和纳米孔测序检测基因编辑后变化的稳健工作流程
Grepore-seq:一种通过长范围PCR和纳米孔测序检测基因编辑后变化的稳健工作流程 研究背景 CRISPR/Cas9系统作为一种RNA指导的DNA内切酶系统,在基因组编辑中得到了广泛的应用。随着其在临床治疗中潜力的不断增加,全面评估基因编辑结果变得尤为重要。然而,目前缺乏一种大规模、经济高效且具有流水线性质的方法来检测基因编辑的结果,特别是插入或缺失大片段的情况。研究表明,CRISPR/Cas9编辑后可能出现非目标效果,如大片段删除和复杂的基因组重排,这对其临床应用提出了挑战。 研究目的和创新 为了解决上述问题,本研究引入了一种新型处理流程“grepore-seq”,其结合了长范围PCR和纳米孔测序,以高效且准确地检测CRISPR/Cas9编辑后的多种基因变化。由于Oxford Nan...