多尺度足迹揭示顺式调控元件在细胞分化和衰老过程的作用

多尺度足迹揭示顺式调控元件在细胞分化和衰老过程的作用 背景介绍 基因表达的调控是细胞命运和疾病发生的关键机制之一,而顺式调控元件(cis-regulatory elements, CREs)在这一过程中扮演了重要角色。CREs通过结合多种效应蛋白(如转录因子和核小体)来动态调控基因的表达。然而,现有的研究方法在测量这些效应蛋白在基因组范围内的结合动态时存在局限性,尤其是在单细胞水平上。这导致我们难以全面理解CREs的结构如何与其功能相关联,尤其是在细胞分化和衰老过程中。 为了解决这一问题,来自Broad Institute of MIT and Harvard、Harvard University等机构的研究团队开发了一种名为PRINT的计算方法,能够从染色质可及性数据中识别DNA-蛋白质相...