GCLink:遺伝子調節ネットワーク推論のためのグラフコントラストリンク予測フレームワーク

研究背景 遺伝子制御ネットワーク(Gene Regulatory Networks, GRNs)は、細胞内の複雑な生物学的プロセスを理解するための重要なツールです。それは転写因子(Transcription Factors, TFs)と標的遺伝子間の相互作用を明らかにし、遺伝子の転写プロセスを制御し、細胞の挙動を調節します。単細胞RNAシークエンシング(single-cell RNA-sequencing, scRNA-seq)技術の発展により、研究者は単細胞解像度で遺伝子発現データを取得できるようになり、これがGRNsの推論に前例のない機会を提供しています。しかし、scRNA-seqデータのスパース性と高い変動性は、GRNsの推論に大きな課題をもたらしています。 現存のGRN推論手法は主に...