GCLink:遺伝子調節ネットワーク推論のためのグラフコントラストリンク予測フレームワーク

研究背景 遺伝子制御ネットワーク(Gene Regulatory Networks, GRNs)は、細胞内の複雑な生物学的プロセスを理解するための重要なツールです。それは転写因子(Transcription Factors, TFs)と標的遺伝子間の相互作用を明らかにし、遺伝子の転写プロセスを制御し、細胞の挙動を調節します。単細胞RNAシークエンシング(single-cell RNA-sequencing, scRNA-seq)技術の発展により、研究者は単細胞解像度で遺伝子発現データを取得できるようになり、これがGRNsの推論に前例のない機会を提供しています。しかし、scRNA-seqデータのスパース性と高い変動性は、GRNsの推論に大きな課題をもたらしています。 現存のGRN推論手法は主に...

ネットワーク理論に基づく膠芽腫のトポロジーの解読

グリオーマのトポロジー景観の解読:ネットワーク理論フレームワークに基づく研究 グリオーマ幹細胞(Glioma Stem Cells, GSCs)は、グリオーマの再発と治療抵抗性の主要な要因とされ、新しい治療法の重要な研究対象となっています。しかし、グリオーマ幹細胞がグリオーマ階層内で果たす役割についての理解が限定的であり、この理解の不足が研究成果の臨床応用を妨げています。この問題を解決するために、Yaoらの研究チームは実験データと内生性ネットワーク理論(Endogenous Network Theory, ENT)を統合し、グリオーマのエネルギー景観を記述するためのコア内生性ネットワークモデルを構築しました。本研究は、グリオーマの生物学的複雑性を明らかにし、治療戦略に新たな理論的視点を提供し...