母体X染色体が雌マウスの認知と脳の老化に及ぼす影響

母源X染色体が雌マウスの認知と脳老化に及ぼす影響 背景紹介 哺乳類において、雌性細胞は2本のX染色体を持ち、1本は母親由来(母源X染色体、Xm)、もう1本は父親由来(父源X染色体、Xp)です。胚発生の過程で、どちらか1本のX染色体がランダムに不活性化されます。このプロセスはX染色体不活性化(X inactivation)と呼ばれます。この不活性化メカニズムにより、雌性個体は細胞レベルでX染色体のモザイク現象(mosaicism)を示します。つまり、一部の細胞は母源X染色体を発現し、他の細胞は父源X染色体を発現します。このモザイク現象は個体間で異なり、一部の個体ではX染色体不活性化が著しく偏る(skew)こともあります。X染色体の親由来は、DNAメチル化などのエピジェネティックなメカニズムを通...

CRISPRガイドのゲノム対応アノテーションは、変異細胞株におけるターゲットを検証し、スクリーニングにおける発見を強化する

ゲノム医学におけるCRISPRガイド配列再注釈:EXORCISEアルゴリズムの応用と検証 学術的背景 CRISPR-Cas9技術は、その登場以来、特に遺伝子の必須性や化学-遺伝相互作用の研究において、遺伝子スクリーニング分野を劇的に変化させました。特定の遺伝子を標的とするガイドRNA(guide RNA, gRNA)の設計を通じて、CRISPR-Cas9システムは細胞内で正確な遺伝子ノックアウトを導入でき、遺伝子機能や疾患におけるその役割の理解を進める助けとなります。しかし、CRISPRライブラリーの設計は通常、参照ゲノムに基づいて行われますが、実際に研究対象となる細胞系(特にがん細胞系)はしばしばゲノム変異を持ちます。これにより、CRISPRガイド配列のミスマッチや偏りが生じ、実験結果の正...

TCR刺激とPifithrin-Aの調節がCRISPRエンジニアリングされたヒトT細胞のゲノム安全性を向上させる

CRISPR-Cas9遺伝子編集技術は、特にキメラ抗原受容体T細胞(CAR-T細胞)の開発において、がん治療への応用が大きく進展しています。しかし、CRISPR編集プロセス中に引き起こされる染色体異常(大規模な欠失、染色体転座、異数性など)は、臨床応用における大きな懸念材料となっています。これまで、CRISPR-Cas9システムのコンポーネントを最適化することでこれらのリスクを軽減する研究が進められてきましたが、T細胞受容体(TCR)の活性化後の急速な増殖など、T細胞の内在的特性がゲノム安全性に与える影響は十分に研究されていませんでした。そこで、Laurenz T. Urschらは、TCR活性化と細胞増殖がCRISPR編集結果に与える影響を調査し、CRISPRでエンジニアリングされたT細胞の...