乳がんは、世界中の女性において最も一般的な悪性腫瘍の一つであり、その発症メカニズムは複雑で、さまざまな遺伝子変異とシグナル伝達経路の異常が関与しています。相同組換え欠損（Homologous Recombination Deficiency, HRD）は、乳がんにおける重要な分子特徴の一つであり、PARP阻害剤（PARPi）治療に対する患者の感受性と密接に関連しています。HRDは通常、BRCA1/2遺伝子の変異によって引き起こされますが、近年の研究では、他の遺伝子の変異もHRDを引き起こす可能性が示されています。TP53遺伝子は、乳がんにおいて最も頻繁に変異する遺伝子の一つであり、細胞周期制御、DNA修復、ゲノム安定性において重要な役割を果たしています。しかし、TP53変異とHRDとの関係は...

鼻咽癌（Nasopharyngeal Carcinoma, NPC）は、鼻咽頭粘膜上皮に由来する悪性腫瘍で、特に東南アジアや南中国地域で高い発生率を示す地理的分布特性を持っています。近年、鼻咽癌の治療において大きな進展が見られましたが、特に再発や転移を伴う患者の予後は依然として不良です。腫瘍の異質性（tumor heterogeneity）は、がんにおいて普遍的な現象であり、腫瘍内の異なる細胞サブタイプが遺伝子発現、機能、行動において差異を示します。この異質性は、腫瘍の発生、進行、治療抵抗性において重要な役割を果たします。しかし、鼻咽癌细胞サブタイプ間の相互作用および腫瘍転移への影響メカニズムは未だ明確ではありません。 エクソソーム（exosomes）は、細胞が分泌するナノサイズの小胞で、タ...

学術的背景 ドキソルビシン（Doxorubicin, Dox）は、腫瘍治療に広く使用されているアントラサイクリン系薬剤ですが、用量依存性の心臓毒性を持ち、心筋症や心不全を引き起こす可能性があります。ドキソルビシンの抗癌効果は顕著ですが、その心臓毒性が臨床応用を制限しています。現在、FDAが承認しているドキソルビシン関連心筋症の治療薬はデキサラゾキサン（Dexrazoxane）のみですが、小児患者での使用は制限されており、ホジキンリンパ腫の小児患者における二次性悪性腫瘍のリスクを増加させる可能性があるためです。したがって、ドキソルビシン誘発性心筋症の予防と治療のための新しい治療ターゲットと戦略を見つけることが臨床現場の緊急の課題となっています。 近年の研究では、鉄依存性の細胞死であるフェロトー...

学術的背景 胚発生の過程において、動脈と静脈の分化（arteriovenous differentiation, AV分化）は、血管の形成と成熟を確保するための重要なステップです。動脈または静脈の識別に欠陥があると、血管の不適切な融合が起こり、いわゆる動静脈奇形（arteriovenous malformations, AVMs）が形成される可能性があります。現在、AVM形成のメカニズムは不明であり、治療選択肢も限られています。哺乳類のAV分化は、胚血流が始まる前にすでに開始されますが、この「血流前メカニズム」（pre-flow mechanism）についてはまだほとんど知られていません。本研究は、血流前の動脈識別におけるSMAD1/5シグナル経路の役割を明らかにし、新たなSMAD1/5シグ...

RNA結合タンパク質RBPMSの血管平滑筋細胞における重要な役割 学術的背景 血管平滑筋細胞（Vascular Smooth Muscle Cells, VSMCs）は大動脈の主要な構造成分です。健康な血管では、VSMCsは成熟した収縮表現型を持ち、血管緊張と血流の調節を担っています。しかし、VSMCsは表現型可塑性を持ち、血管壁の損傷や心血管疾患（例えば、動脈硬化、高血圧など）において、より増殖性と合成性の高い間葉系の状態に脱分化します。この表現型の変換は、細胞の転写産物に大きな変化をもたらし、収縮マーカーの喪失を伴います。現在、VSMCsの表現型を定義する分子ネットワークは主に転写レベルのマーカー発現に焦点を当てていますが、RNAスプライシングなどの転写後調節の役割はまだ十分に解明されて...

腫瘍の進化過程において、ゲノムコピー数変異（Copy Number Alterations, CNAs）は腫瘍の異質性と進化を駆動する重要な要因です。これらの変異を理解することは、個別化されたがん診断や治療法の開発にとって極めて重要です。単一細胞シーケンス技術は、単一細胞レベルまで深く分析できる最高解像度のコピー数解析を提供します。しかし、低リード深度（low read-depth）の全ゲノムシーケンスデータは、コピー数変異の検出に大きな統計的および計算上の課題をもたらします。既存の計算方法の多くは細胞間の進化的関係を無視しており、その結果、検出精度が低下しています。そのため、細胞の進化歴史を組み込んだコピー数検出方法の開発が現在の研究における緊急の課題となっています。 論文の出典 本論文は...

背景紹介 タンパク質の翻訳後修飾（Post-Translational Modifications, PTMs）は、遺伝子転写、DNA修復、タンパク質相互作用などの細胞活動を調節する重要なメカニズムです。その中でも、システイン（Cysteine）は希少なアミノ酸であり、そのチオール基（Thiol Group）を介して多様なPTMsに関与し、特に酸化還元平衡やシグナル伝達プロセスにおいて重要な役割を果たしています。S-スルフヒドル化（S-Sulfhydration）は重要なPTMの一つであり、心血管疾患や神経疾患の発症と進行に密接に関連しています。しかし、S-スルフヒドル化の具体的なメカニズムは未解明であり、特にその部位の識別において大きな課題が残されています。 従来のS-スルフヒドル化部位の...

免疫細胞は多様な刺激に応答してサイトカイン駆動の極化を経て、その転写プロファイルや機能状態が変化します。この動的なプロセスは、健康や疾患における免疫応答の中心的な役割を果たしています。しかし、単一細胞RNAシーケンシング（scRNA-seq）データにおけるサイトカイン駆動極化を評価するための体系的なアプローチはこれまで欠けていました。この問題を解決するために、研究者たちは単一細胞統一極化評価（SCUPA）を開発しました。これは、免疫細胞極化を包括的に評価する初めての計算手法です。 論文の出典 この論文は、Wendao LiuとZhongming Zhaoによって共同執筆されました。彼らはそれぞれThe University of Texas MD Anderson Cancer Center...

単一細胞トランスクリプトームシーケンシング（single-cell RNA sequencing, scRNA-seq）技術の登場により、細胞の発生と分化過程における遺伝子発現のダイナミクスをこれまでにない解像度で研究することが可能になりました。しかし、生物学的プロセスの複雑さから、異なる条件下での細胞発生軌跡はしばしば非対称であり、データの統合と比較に課題をもたらしています。既存の方法は通常、異なる条件下のサンプルを統合してからクラスタリング分析を行ったり、共有される軌跡を推測したりすることを前提としていますが、これらの方法は非対称な軌跡を扱う際に効果的ではなく、重要な差異発現遺伝子（differentially expressed genes, DEGs）を見逃す可能性があります。 この...

背景紹介 脊髄損傷（Spinal Cord Injury, SCI）は、現代医学が直面する大きな課題の一つであり、特に神経機能の回復が重要です。研究によると、ニューロンは脊髄の再生において重要な役割を果たしますが、複雑な病理環境の中で、ニューロンはさまざまな要因の影響を受け、急速に老化状態に陥ります。老化した神経細胞は増殖能力を失うだけでなく、老化関連分泌表現型（Senescence-Associated Secretory Phenotype, SASP）を分泌して周囲の細胞を老化状態に誘導し、悪循環を形成し、さらに局所組織の退化を悪化させます。既存の治療法である老化細胞を除去するsenolytic療法は、短期的な症状緩和には有効ですが、細胞老化の根本的な問題を解決することはできません。そ...