NOMPC离子通道铰链形成启动机械感觉的弹簧门

NOMPC离子通道铰链形成门控弹簧启动机械感觉 学术背景 机械感觉是生物体感知外界机械刺激并转化为电信号的过程,这一过程在触觉、听觉、重力感知以及内脏和肢体运动中起着至关重要的作用。机械感觉的起始依赖于机械敏感的离子通道(Mechanosensory Transduction Channels, MET通道),这些通道通过门控弹簧(gating spring)将机械力传递到通道的闸门,从而控制通道的开闭。门控弹簧的弹性使得通道能够在机械刺激的作用下在开闭状态之间切换。 长期以来,科学界对门控弹簧的分子身份存在争议。大部分研究聚焦于力传递蛋白如锚蛋白(ankyrin)重复结构域,认为它们可能充当门控弹簧。然而,这些假设缺乏直接的实验证据。本研究通过结合蛋白质结构域复制、机械测量、电生理学、分子...

针对原子间作用力的几何增强预训练

针对原子间作用力的几何增强预训练 引言 分子动力学(MD)模拟在物理、化学、生物和材料科学等领域扮演着重要角色,为原子水平的过程提供了洞见。MD模拟的精确度和效率取决于所选择描述分子体系中原子相互作用的相互原子作用力(interatomic potentials)函数。经典MD使用经验公式,参数需要拟合,计算代价低但精度不够。而第一性原理MD则通过求解薛定谔方程获得精确的相互作用力,但计算量极大。因此,机器学习相互原子作用力(MLIPs)通过使用机器学习模型拟合第一性原理计算的能量和力而达到接近ab initio的精度以及较高效率,成为一种有前景的替代方案。 MLIPs的性能和通用性受限于标记数据的稀缺性,因为获取标记数据需要耗费巨大的第一性原理计算代价。各种自监督学习方法已被探索过,以从大...