RELMβ在食物过敏中的关键作用 学术背景 食物过敏（Food Allergy, FA）是一种常见的免疫系统疾病，尤其在儿童中发病率较高。食物过敏的发生与免疫系统对食物抗原的异常反应有关，尤其是2型免疫反应的失调。2型免疫反应通常是对寄生虫和毒素的防御机制，但其失调会导致食物过敏和过敏性休克等病理反应。尽管食物过敏的机制已有一定研究，但关于免疫耐受的维持和破坏的具体机制仍不清楚。特别是，肠道微生物群在食物过敏中的作用尚未完全阐明。 本研究旨在探讨一种由肠道杯状细胞分泌的蛋白质——抵抗素样分子β（Resistin-like molecule β, RELMβ）在食物过敏中的作用。RELMβ已被证明在肠道免疫和微生物群调控中发挥重要作用，但其在食物过敏中的具体机制尚不明确。通过研究RELMβ如何...

在复杂微生物组中使用基因排列分析进行菌株追踪揭示物种特定的进化模式 背景介绍 微生物种群通过单核苷酸突变和结构变化（如重组、插入和缺失）分化为不同的菌株。大多数菌株比较方法主要量化单核苷酸多态性（SNPs）的差异，而忽视了结构变化。然而，重组是许多物种（包括人类病原体）表型多样化的重要驱动因素。本文介绍了一种名为SynTracker的工具，该工具使用基因排列（基因组中同源区域的序列块顺序）来比较微生物菌株。基因排列是一种尚未被现有菌株比较工具充分利用的丰富的基因组信息来源。SynTracker对SNP敏感度低，无需数据库，且对测序错误具有鲁棒性。它在追踪元基因组数据中的菌株时优于现有工具，特别适用于噬菌体、质粒及其他数据有限的情境。应用于单物种数据集和人类肠道元基因组时，SynTracker...