单细胞转录组学中的轨迹对齐:Tragedy方法的创新与应用

单细胞转录组测序(single-cell RNA sequencing, scRNA-seq)技术的出现,为研究细胞发育和分化过程中的基因表达动态提供了前所未有的分辨率。然而,由于生物过程的复杂性,不同条件下的细胞发育轨迹往往是不对称的,这给数据的整合和比较带来了挑战。现有的方法通常依赖于将不同条件下的样本整合后再进行聚类分析或推断共享轨迹,但这些方法在处理不对称轨迹时往往效果不佳,可能会掩盖关键的差异表达基因(differentially expressed genes, DEGs)。 为了解决这一问题,研究人员开发了一种新的方法——Trajectory Alignment of Gene Expression Dynamics (Tragedy)。Tragedy方法能够在不进行数据集整合...