乳腺癌中甲羟戊酸途径的调控及其在肿瘤发生和肺转移中的作用 背景介绍 乳腺癌是全球女性中最常见的癌症之一，其发生和转移机制复杂，涉及多种信号通路和代谢途径的异常调控。近年来，代谢重编程（metabolic reprogramming）被认为是癌症细胞适应其快速增殖和转移需求的重要机制之一。其中，甲羟戊酸途径（mevalonate pathway）在多种癌症中被发现显著上调，尤其是在乳腺癌中，该途径被认为在肿瘤发生和转移中发挥重要作用。然而，甲羟戊酸途径的具体调控机制及其在乳腺癌中的功能尚未完全阐明。 甲羟戊酸途径是细胞内胆固醇和异戊二烯类化合物（isoprenoids）生物合成的关键代谢途径。该途径的限速酶是3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶（HMGCR），其活性受到多种信号通路的调控，包括...
全基因组范围甲基化研究揭示PTSD相关的新DNA甲基化位点：23个军民队列的Meta分析 学术背景及研究目标 创伤后应激障碍（Posttraumatic Stress Disorder, PTSD）是一种严重的精神疾病，通常发生在个人经历极端创伤事件后。PTSD的症状包括侵入性记忆、对触发记忆情境的回避或情感麻木，以及持续的高警觉反应，这些特征可能显著影响心理与生理健康。PTSD已被证明与慢性疾病风险增加相关，如心血管疾病等，这与其患者自我保健水平较低、药物依从性差及更高的物质使用率有关。 尽管大多数人遭遇过创伤事件，但只有少数发展为PTSD，这表明遗传和环境因素对PTSD的发生具有重要作用。以往的全基因组关联研究（Genome-Wide Association Studies, GWAS）...
牙齿形态在人类进化过程中表现出显著的多样性，然而，关于这种多样性的遗传基础知之甚少。牙齿作为进化研究中的重要特征，因其保存完好且形态多样，被广泛用于分类学和系统发育分析。现代人类群体中，牙齿形态的变异也被用于人口历史分析和个体识别。尽管动物研究已经确定了数十个与牙齿发育相关的基因，但关于普通人群中牙齿形态变异的遗传基础的研究仍然有限。全基因组关联研究（GWAS）虽然已经揭示了许多与常见表型变异相关的单核苷酸多态性（SNP），但这些关联的生物学机制大多尚未明确，尤其是非编码SNP的作用。 本研究旨在通过多组学分析，探索现代人类牙齿冠部尺寸变异的遗传基础。研究团队通过对混合大陆血统的哥伦比亚人群进行全基因组关联分析，识别出18个与牙齿冠部尺寸显著相关的基因组区域，并进一步验证了其中7个区域在独立...
分子分类在滤泡性淋巴瘤中的新进展：基于RNA测序和免疫组化的双分型预测模型 滤泡性淋巴瘤（follicular lymphoma, FL）是一种B细胞恶性肿瘤，其临床进展较缓慢，中位总生存期可达20年。然而，FL的异质性特征使病人在治疗反应和预后上表现出显著差异。尽管传统临床-生物学参数（如FLIPI、FLIPI-2和PRIMA-PI）在指导治疗中取得了一定成效，但这些工具在个体化精确诊断和特定疗法选择中仍显不足。因此，精准医学需求愈发迫切。 过去的研究中，弥漫性大B细胞淋巴瘤（DLBCL）的分子起源分类法在ABC与GCB亚型的预后评估中表现出重要价值，但在FL中的分子分类仍未完全明确。已有的初步研究暗示FL可能具有类似于正常生发中心（germinal center, GC）B细胞和记忆（m...
单细胞分析揭示老年与年轻小鼠前列腺的差异 学术背景 前列腺是男性生殖系统的重要组成部分，随着年龄的增长，前列腺会发生增生，可能导致尿道受压，进而引发排尿功能障碍及相关症状，并增加前列腺癌的风险。尽管前列腺老化的重要性不言而喻，但其分子机制尚未完全阐明。单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术为揭示细胞异质性和衰老过程中的基因表达变化提供了强有力的工具。尽管已有大量关于前列腺的单细胞研究，但这些研究尚未系统地应用于小鼠前列腺老化的表征。由于获取无疾病的人类前列腺组织较为困难，小鼠作为与人类具有遗传和生理相似性的模式生物，为研究衰老机制提供了替代方案。 论文来源 该研究由Yang Li、Yuhong Ding等来自华中科技大学同济医学院附属同济医院的研究团队完成，并于2024年发表在《Biom...
Revumenib 改变 KMT2A 重排白血病的治疗格局 学术背景 白血病是一种由造血系统异常引起的恶性疾病，其中 KMT2A 重排（KMT2A-rearranged, KMT2A-r）白血病是一种常见的亚型，尤其在儿童和成人急性髓系白血病（AML）中占比较高。KMT2A 基因（lysine methyltransferase 2A gene）的重排会导致其与超过 100 种不同的基因融合，形成致癌的 KMT2A 融合蛋白。这些融合蛋白通过招募染色质复合物，维持干细胞相关基因（如 HOX 和 MEIS1）的表达，从而促进白血病的发生和发展。 Menin 是一种与 KMT2A 相互作用的蛋白质，对维持 KMT2A 融合蛋白的致癌功能至关重要。因此，靶向 Menin-KMT2A 相互作用的抑制...
学术背景 肝脏再生是一个复杂的生物学过程，涉及多种细胞类型和信号通路的协调作用。在肝脏部分切除后，剩余的肝脏组织会通过一系列精确调控的细胞增殖和免疫反应来恢复其功能和质量。尽管已有大量研究探讨了肝脏再生的机制，但某些细胞类型在这一过程中的具体作用仍不完全清楚。髓系来源的抑制性细胞（Myeloid-Derived Suppressor Cells, MDSCs）是一类异质性的未成熟髓系细胞，已知在癌症、伤口愈合等过程中发挥免疫调节作用。然而，MDSCs在肝脏再生中的具体功能，尤其是其对肝细胞增殖和免疫调节的影响，尚未得到充分研究。 本研究旨在探讨粒细胞样MDSCs（G-MDSCs）在肝脏再生过程中对肝细胞增殖和免疫调节的作用。通过基因表达谱分析、细胞培养实验和质谱流式细胞术（CyTOF）等技术...
棉花种群水平DNA甲基化多态性研究揭示表观基因组对复杂性状的贡献 背景与研究动机 在过去几十年中，基因组和基因多样性通过全基因组关联研究（GWAS）被广泛研究，为理解作物性状变异提供了理论基础。然而，DNA甲基化等表观遗传修饰在调控作物性状方面的作用依旧相对不明确。DNA甲基化，是一种重要的表观遗传标记，通过在胞嘧啶（Cytosine）上加上甲基基团，调控基因表达、维持基因组稳定性，并在多种作物的农艺性状中起关键作用。研究发现，基因组甲基化水平的多态性与生态适应性状有关，但在自然作物种群中，表观遗传变异对作物性状的贡献仍然需要更深入的探索。 基于此需求，来自浙江大学和阿里巴巴集团等研究机构的科学家们开展了一项系统的研究，首次在207个棉花品种中生成了高质量的甲基组、转录组和基因组数据，扩展了...
研究背景与目的 本研究聚焦于成年大脑皮层沟回的复杂形态学特征，特别是大脑沟（sulci）的线性与复杂性形态的分类及其形成机制。沟是大脑皮层表面的沟槽结构，对应不同的遗传特性、功能区以及胎儿时期的沟回发育时间。本研究团队试图通过自动化的数据管道分析，探索大脑沟回结构的分类特征及其与基因表达梯度的关系。此项研究的重要性在于：尽管大脑表面结构的个体差异极大，但其形成过程可能遵循某种规则。本研究旨在为沟回形态提供一种定量化分类体系，揭示沟回复杂性的发育来源，并为今后的神经发育与疾病研究提供新的视角。 研究来源与作者 此项研究由William E. Snyder及其团队完成，发表在2024年10月的《Neuron》期刊上。研究团队来自剑桥大学、美国国家精神卫生研究院、伦敦国王学院、巴黎萨克雷大学等多家...
ALS逆转表型的遗传关联研究 肌萎缩侧索硬化症（ALS）是一种致命的神经退行性疾病，表现为上、下运动神经元的死亡、进行性无力以及最终的呼吸衰竭。然而，个别ALS患者展现出了不寻常的临床逆转现象，即症状显著且持久地改善。这种现象被称为“ALS逆转”，其生物学基础尚不清楚。为了探索这一罕见表型背后的遗传因素，一组研究人员进行了全基因组关联研究（GWAS），尝试找出与ALS逆转表型相关的遗传关联。 论文背景与研究目的 ALS是一种严重的神经退行性疾病，其病程通常是不可逆转且致命的。但在少数病例中，患者的症状却出现了显著和持久的改善，这与ALS的自然病程不符。这些逆转病例自1960年代起便有所报导，但是遗传因素在其中的角色尚未明确。研究人员推测，可能正如遗传因素在ALS病因中扮演重要角色，遗传因素也...