単一細胞視点から見たエピジェネティックな老化の性質

単一細胞視角からのエピジェネティック老化の本質の研究 研究背景 生物学研究が進展するにつれて、科学者たちはDNAメチル化(DNA methylation, DNAm)の変化が年齢を予測する上で最も信頼性の高い指標の一つであるエピジェネティック時計を構成していることを発見しました。しかし、これらの時計が具体的に測定している老化の側面のメカニズムはまだ明らかではありません。本研究は、マウスの組織と単一細胞のDNAmダイナミクスを比較することで、エピジェネティック老化の特性を明らかにし、さらに単一細胞RNAシーケンシング(single-cell RNA sequencing, scRNA-seq)分析で我々の発見を支持することを目的としています。 研究出典 本研究はAndrei E. Tarkho...

複数の先行知識を持つグラフニューラルネットワークによるマルチオミクスデータ分析

複数の先行知識を持つグラフニューラルネットワークによるマルチオミクスデータ分析

医学多組学データ分析における多重先験知識グラフニューラルネットワーク 背景紹介 精密医療は将来の医療保健において重要な分野であり、患者に個別化された治療計画を提供することにより、治療効果を改善しコストを削減します。例えば、乳がん患者の複雑な臨床、病理、および分子特性を考えると、同じ治療が異なる効果を示すことがあります。バイオ医学技術の急速な発展に伴い、多組学データを通じて疾病の特性化が可能になっています。多組学アプローチは単一組学アプローチに比べて、複数のデータ間で一貫性と補完的な情報を捉えることができ、より正確かつ深くモデルを構築することができます。例えば、がんゲノム図譜(The Cancer Genome Atlas, TCGA)は、mRNA 発現、DNA メチル化、およびコピー数変異(...