シンテニー分析を用いた複雑な微生物群の株追跡により種ごとの進化モードが明らかに

複雑な微生物群集における遺伝子配列分析を用いた菌株追跡による種特異的進化パターンの解明 背景紹介 微生物の集団は、単一ヌクレオチドの変異と構造変化(組換え、挿入、欠失など)を通じて異なる菌株に分化します。大多数の菌株比較方法は主に単一ヌクレオチド多型(SNP)の差異を量化し、構造変化を無視しています。しかし、組換えは多くの種(ヒト病原体を含む)の表現型の多様化の重要な推進要因です。本稿では、SynTrackerと呼ばれるツールを紹介します。このツールは遺伝子配列(ゲノム内の相同領域のシーケンスブロックの順序)を使用して微生物菌株を比較します。遺伝子配列は既存の菌株比較ツールによって十分に活用されていない豊富なゲノム情報源です。SynTrackerはSNP感度が低く、データベースを必要とせず、...

構造と活性化に基づくBRETセンサーはGPCR- Gタンパク質結合について異なるレポートを行う

GPCR-G蛋白結合のバイオセンサー差異研究 背景紹介 G蛋白結合受容体(GPCRs)は、細胞膜を貫通するシグナル伝達の重要な分子であり、Gα、Gβ、Gγサブユニットからなるヘテロ三量体G蛋白と選択的に結合し、細胞内の多種多様なシグナル伝達過程を調節します。GPCRの機能選択性を研究することは、その生物学的機能を理解し、新薬を開発する上で重要です。しかし、GPCRとG蛋白の選択的結合は必ずしも単純ではなく、異なるリガンドが受容体を異なるGα蛋白ファミリーのサブタイプに偏らせることができます。この複雑性を研究するために、生物発光共鳴エネルギー転移(BRET)技術が広く利用され、GPCR-G蛋白相互作用を監視するために多数のバイオセンサーが開発されています。ただし、異なるタイプのBRETバイオセ...