情報エントロピー強化BERTと多方向GRUを統合したS-硫化部位予測のためのアンサンブル深層学習法

背景紹介 タンパク質の翻訳後修飾(Post-Translational Modifications, PTMs)は、遺伝子転写、DNA修復、タンパク質相互作用などの細胞活動を調節する重要なメカニズムです。その中でも、システイン(Cysteine)は希少なアミノ酸であり、そのチオール基(Thiol Group)を介して多様なPTMsに関与し、特に酸化還元平衡やシグナル伝達プロセスにおいて重要な役割を果たしています。S-スルフヒドル化(S-Sulfhydration)は重要なPTMの一つであり、心血管疾患や神経疾患の発症と進行に密接に関連しています。しかし、S-スルフヒドル化の具体的なメカニズムは未解明であり、特にその部位の識別において大きな課題が残されています。 従来のS-スルフヒドル化部位の...

E-Predictor: プルリクエスト受け入れの早期予測手法

プルリクエスト受け入れの早期予測に関する研究の突破口 近年、オープンソースソフトウェア(Open-Source Software, OSS)の開発は主流のソフトウェア開発モデルの一つとなりつつあります。このモデルは開発者間での協力を大いに依存しており、プルリクエスト(Pull Request, PR)の仕組みは分散型ソフトウェア開発における協力の効率を向上させる手段として広く採用されています。GitHubなどのOSSプラットフォームでは、PRを通じて開発者はコード変更要求を提出し、プロジェクトの管理者(インテグレーター)がコードレビューを行い、そのコードを主ブランチにマージするかどうかを決定します。しかし、OSSプロジェクトの活発化に伴い、PRの数が急増し、管理者の負担が増大するとともに、P...