地中海Fagaceae生态系统受疫霉菌和气候变化影响的挑战 学术背景 地中海地区的Fagaceae（壳斗科）生态系统，包括橡树（Quercus ilex和Quercus suber）和栗树（Castanea sativa），是欧洲南部重要的生态和经济资源。然而，近年来，这些生态系统面临着严重的衰退问题，主要原因之一是外来入侵病原体——Phytophthora cinnamomi（疫霉菌）的传播。这种病原体通过感染树木的根系，导致树木逐渐衰弱甚至死亡。此外，气候变化加剧了这一问题，尤其是地中海地区的气候变暖和干旱化趋势，为疫霉菌的传播和繁殖提供了更有利的条件。 为了应对这一挑战，来自意大利、西班牙和葡萄牙的研究机构合作撰写了一篇综述性论文，旨在全面分析疫霉菌在地中海Fagaceae生态系统中的...

这项研究运用机器学习框架探索了构成软组织肉瘤的基础细胞状态及其细胞生态系统,并将其与患者预后及免疫疗法反应性进行了关联分析。 研究背景:软组织肉瘤是一种罕见且异质性强的结缔组织恶性肿瘤,目前对转移期患者的系统治疗选择有限。虽然最近的研究显示免疫检查点抑制剂(ICI)可以使部分转移期肉瘤患者获得持久缓解,但大多数患者并不能从中获益。传统的生物标志物(如肿瘤突变负荷和PD-L1表达)无法准确预测肉瘤患者对ICI的反应。研究人员推测,独特的肿瘤微环境可能是导致这一现象的关键因素。 研究过程:研究人员组建了一个299例局部期肉瘤患者的RNA-seq表达谱训练队列,以及一个310例局部期肉瘤患者的基因芯片数据验证队列,并结合相关临床注释信息。他们运用Ecotyper机器学习框架,从肉瘤的bulk转录组...