Analyse de séquence : Alignement de séquences d'ADN à l'aide de modèles Transformer

Sciences de l'information, Intelligence artificielle, Sciences de la vie, Génie biologique, Génétique,
Alignement de séquences d'ADN   Modèles Transformer   Analyse génomique   Apprentissage profond   Bioinformatique  

Contexte académique L’alignement des séquences d’ADN est une tâche centrale en génomique, visant à localiser les fragments courts d’ADN (reads) aux positions les plus probables sur un génome de référence. Les méthodes traditionnelles se divisent généralement en deux étapes : l’indexation du génome, suivie d’une recherche efficace pour localiser les...

Évaluation des grands modèles de langage pour la découverte de la fonction des ensembles de gènes

Sciences de l'information, Intelligence artificielle, Médecine, Sciences de la vie, Biochimie, Génétique,
Grands modèles de langage   Fonction des ensembles de gènes   Génomique fonctionnelle   Ontologie génique   Bioinformatique   Intelligence artificielle   Expression génique  

Évaluation des modèles linguistiques pour découvrir les fonctions des ensembles géniques : les performances remarquables de GPT-4 Contexte scientifique Dans le domaine de la génomique fonctionnelle, l’analyse d’enrichissement des ensembles géniques (gene set enrichment analysis) est une méthode essentielle pour comprendre les fonctions géniques et ...

Prédire les résultats du carcinome épidermoïde de l'œsophage à l'aide de scRNA-seq et de RNA-seq en vrac : une étude de développement et de validation de modèle

Médecine, Oncologie, Sciences de la vie, Biologie cellulaire, Immunologie,
Carcinome épidermoïde de l'œsophage   Métabolisme du glucose   Infiltration immunitaire   Pronostic   Séquençage d'ARN unicellulaire   Séquençage d'ARN en vrac   Bioinformatique  

Étude sur un modèle de pronostic du carcinome épidermoïde de l’œsophage basé sur le séquençage RNA monocellulaire et le séquençage RNA en vrac Contexte de la recherche Le carcinome épidermoïde de l’œsophage (Esophageal Squamous Cell Carcinoma, ESCC) est l’une des tumeurs malignes les plus courantes dans le monde, en particulier dans les régions d’A...