MostPlas: プラスミド宿主範囲予測のための自己修正多ラベル学習モデル

プラスミド(plasmid)は、細菌の染色体DNAとは独立した小型の環状二本鎖DNA分子であり、水平遺伝子伝達(horizontal gene transfer)を通じて宿主細菌が抗生物質耐性や金属耐性などの有益な特性を獲得するのを助けます。一部のプラスミドは、複数の微生物間で転移、複製、または持続することが可能であり、これらは広宿主範囲プラスミド(broad-host-range plasmids, BHR plasmids)と呼ばれます。BHRプラスミドの宿主範囲を正確に予測することは、プラスミドがどのように細菌の進化を促進し、耐性遺伝子を広めるかを理解するだけでなく、組換えベクターの開発においても重要な意義を持ちます。しかし、現在のところ、BHRプラスミドの詳細な宿主範囲ラベルを提供す...

抗生物質耐性菌種識別のための紙ベースセンサーの進展

紙ベースセンサーの抗生物質耐性細菌検出における進展 背景紹介 抗生物質耐性(Antimicrobial Resistance, AMR)は、現代の世界的な公衆衛生が直面している主要な課題の一つです。抗生物質の広範な使用と乱用により、ますます多くの細菌が抗生物質に対して耐性を持つようになり、従来の治療法が無効となっています。世界疾病負担研究(Global Burden of Disease Study)のデータによると、2019年には世界で約770万人が細菌感染で死亡し、その多くが抗生物質耐性に関連していました。抗生物質耐性細菌の急速な拡散は、医療コストを増加させるだけでなく、入院期間を延ばし、死亡率を著しく引き上げています。そのため、抗生物質耐性細菌を特定するための迅速で正確かつ経済的な検出...

MCIMおよびSCIM表現型法を用いた火傷創傷から分離されたIMP、VIM、NDMメタロ-β-ラクタマーゼ産生Pseudomonas aeruginosaのスクリーニングにおける有効性の検討

mCIMおよびsCIM表現型法による熱傷創傷におけるIMP、VIM、NDMメタロ-β-ラクタマーゼ産生緑膿菌のスクリーニングの有効性の検討 背景紹介 緑膿菌(Pseudomonas aeruginosa)は、環境中に広く存在するグラム陰性細菌であり、特に病院環境でよく見られます。これは熱傷創傷感染の第二の主要な病原体であり、しばしば重篤な感染を引き起こし、特にカルバペネム系抗生物質に対する高い耐性を示します。この耐性は、主に細菌が産生するメタロ-β-ラクタマーゼ(MBLs)、例えばIMP、VIM、NDM酵素に起因しています。これらの酵素はカルバペネム系抗生物質を分解し、治療を極めて困難にします。したがって、これらの酵素の産生を迅速かつ正確に検出することは、臨床治療を指導する上で極めて重要です...

アズトレオナム-アビバクタム:多剤耐性肺炎クレブシエラ複合体に対する新たな組み合わせ

Aztreonam-Avibactam による多剤耐性肺炎クレブシエラ複合体に対する活性研究 背景紹介 肺炎クレブシエラ複合体(Klebsiella pneumoniae complex, KPC)は、公衆衛生に深刻な脅威をもたらす機会性病原体の一群です。近年、多剤耐性(multidrug-resistant, MDR)肺炎クレブシエラの感染率が著しく上昇し、治療選択肢が非常に限られています。特にカルバペネマーゼ(carbapenemase)を産生する菌株は、多くの抗生物質に対して耐性を示し、臨床治療に大きな課題をもたらしています。この問題に対処するため、研究者は新しい抗生物質の組み合わせを探求し、効果的な治療法を見つけようとしています。 Aztreonam-avibactam(AZA)は、...

抗生物質の終焉を描くことで、抗生物質への期待と要求が低下する

将来の「抗生物質後の時代」の脅威の下で抗生物質への期待と需要を減らす方法 序論 抗生物質耐性は世界的な公衆衛生の脅威となりつつあります。この耐性の進化は生物学的プロセスであるにもかかわらず、特に農業生産や人間の医療における不必要な抗生物質の使用がこの進行を大幅に加速させました。この問題に対処するために、公衆衛生機関や活動は、抗生物質の乱用の結果を強調する脅威的な情報を伝達することがよくあります。例えば、抗生物質が完全に効かなくなる未来の「終末シナリオ」を描いています。しかし、この脅威的な情報の有効性は依然として議論の余地があり、特にCOVID-19のパンデミックの後では、一般市民の認識が変化した可能性があります。本研究は、この脅威的な情報の有効性とCOVID-19パンデミック中におけるその影...