単細胞解像度での遺伝子信号パターン分析による遺伝子空間のマッピング

単細胞解像度での遺伝子空間マッピング:遺伝子シグナルパターン分析(GSPA)研究 学術的背景 単細胞RNAシークエンシング(single-cell RNA sequencing, scRNA-seq)技術は、近年の生物学研究において大きな進展を遂げており、特に細胞状態空間(cellular state space)の組織構造を明らかにする上で重要な役割を果たしています。しかし、細胞状態空間をマッピングするための多くの計算手法が開発されている一方で、遺伝子空間(gene space)のマッピングや埋め込み(embedding)に関する研究は比較的少ない状況です。遺伝子発現は高度に組織化されており、遺伝子間は複雑な生物学的プロセスや経路を通じて協調して機能しています。しかし、生物学的および技術的...

遺伝子共発現におけるネットワーク全体のリスク収束が精神分裂症リスクの再現可能な遺伝子ハブを特定

精神分裂症リスクの遺伝子ネットワーク凝集メカニズム——《Neuron》ジャーナルの最新研究解説 近年、精神分裂症(schizophrenia, SCZ)の遺伝研究は顕著な進展を遂げており、特に全ゲノム関連解析(GWAS)の推進により、多くの疾患関連遺伝的変異が明らかになりました。しかし、GWASの主な発見は依然として変異部位に集中しており、特定の「リスク遺伝子」を直接特定するわけではありません。この制限は、疾患メカニズムの解釈や新療法の開発を推進する上でボトルネックとなっています。こうした課題を克服するために、Borcukらは「汎遺伝子モデル」(omnigenic model)に基づくネットワーク凝集理論を提案し、それに基づく研究を行い、精神分裂症における遺伝子共発現ネットワーク内のリスク凝...