单细胞视角下的表观遗传年龄性质

单细胞视角下的表观遗传老化本质研究 研究背景 随着生物学研究的深入,科学家们发现DNA甲基化(DNA methylation, DNAm)的变化构成了预测年龄最可靠的指标之一——表观遗传时钟。然而,这些时钟确切衡量的衰老方面的机制尚不清楚。本研究旨在通过对比小鼠组织和单细胞的DNAm动态,阐明表观遗传老化的特性,并进一步通过单细胞RNA测序(single-cell RNA sequencing, scRNA-seq)分析支持我们的发现。 研究来源 本研究由Andrei E. Tarkhov等人撰写,其来自Brigham and Women’s Hospital和Harvard Medical School等机构,于2024年6月由《Nature Aging》(自然老化)期刊发表。 研究方法 ...

结合多重先验知识的图神经网络用于多组学数据分析

结合多重先验知识的图神经网络用于多组学数据分析

医学多组学数据分析中的多重先验知识图神经网络 背景介绍 精确医学是未来医疗保健的重要领域,因为它为患者提供个性化的治疗方案,从而改善治疗效果并降低成本。例如,由于乳腺癌患者存在复杂的临床、病理和分子特征,相同的治疗可能表现出不同的效果。随着生物医学技术的高速发展,疾病的表征可以通过多组学数据来实现。多组学方法相较单组学方法能够在多个数据间捕捉一致和互补的信息,从而建立更加准确和深入的模型。例如,癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas, TCGA)提供了包括mRNA表达、DNA甲基化和拷贝数变异(Copy Number Variation, CNV)在内的多组学数据。因此,在精确医学的各类任务中引入多组学数据变得必要,这些任务包括药物反应预测、基因发现和生存分析等。 作...