非经典蛋白质组的全面发现与功能表征

学术背景 人类基因组计划(Human Genome Project)的完成极大地推动了我们对复杂生物过程的全基因组理解。然而,基因组中仅有约1%的区域编码蛋白质,其余大部分为非编码区域,产生大量的非编码RNA(ncRNA),如长链非编码RNA(lncRNA)。近年来,越来越多的研究表明,这些非编码RNA可能编码新型肽段,并在细胞活动中发挥重要作用。例如,某些lncRNA编码的肽段在肌肉生理功能、代谢调节、免疫反应等过程中扮演关键角色。然而,由于技术限制,这些非经典翻译产物(如新型肽段)的系统识别和功能表征仍然是一个巨大的挑战。 胃癌作为全球第五大常见癌症,具有高度异质性和缺乏早期诊断标志物的特点。尽管基因组学、转录组学和蛋白质组学研究已经揭示了胃癌的多组学特征,但针对新型肽段的研究仍然较少。...

CRISPR依赖性筛选在原代造血干细胞中鉴定出KDM3B是IDH2和TET2突变基因型的特异性易感性

CRISPR依赖筛选在原代造血干细胞中识别出KDM3B作为IDH2和TET2突变基因型的特异性易感性 背景和研究意义 克隆性造血(Clonal Hematopoiesis, CH)是指由特定突变的造血干细胞(Hematopoietic Stem Cell, HSC)引发的基因上不同的亚群细胞的异常生长。这种现象在60岁以上的人群中十分普遍,影响了超过20%的人口。CH与急性髓系白血病(AML)的恶性转化风险增加有关,并且还与更高的全因死亡率和各种与年龄相关的疾病(如心血管疾病)相关联。尽管之前的基因研究已经识别出与CH相关的基因突变,但迄今为止在CH中识别治疗靶点的工作还存在挑战。这主要是因为缺乏适用于研究初级造血干细胞(HSPC)的体外平台。在这一研究中,作者利用HSPC和骨髓内皮细胞(B...