配列に基づく機能メタゲノミクスが環境マイクロバイオームにおける機能的COPA遺伝子の新しい自然多様性を明らかにした 環境マイクロバイオームにおける機能遺伝子/タンパク質の自然多様性は、進化および生物工学研究の重要な構成要素です。銅(Cu)耐性遺伝子COPAの世界的な微生物における多様性をより深く理解するために、本研究では配列ベースの機能メタゲノミクスアプローチを採用しました。この研究は、メタゲノムアセンブリ技術、ローカルBLAST、進化的トレース分析(ETA)、化学合成、および従来の機能ゲノミクスを組み合わせただけでなく、環境DNA(eDNA)からCOPA遺伝子の多様性を効率的に掘り起こすことに成功しました。 研究背景 微生物の進化過程で多様な機能遺伝子/タンパク質が生み出され、これらの遺伝...

米国における大規模な前向きコホート研究が屋外空気汚染と成人の血液系癌サブタイプとの潜在的な関連性を明らかにする 研究の背景および目的 近年、屋外空気汚染が人間の健康に与える影響は広範な関心を集めています。国際がん研究機関（IARC）は2013年から屋外空気汚染と細かい粒子物質（PM）をグループ1のヒト発癌物質に分類しており、主に肺癌研究からの証拠によります。現在の研究データは空気汚染と血液癌との間に何らかの関連を示唆していますが、血液癌の病理学的異質性のため、これらの研究は癌のサブタイプの詳細な区別を無視する傾向にあり、関連する結論は明確で一貫していないことが多いです。様々な血液癌サブタイプ間の関係をより深く理解するために、本研究は米国がん協会のがん予防研究II栄養コホート（American...

化学暴露が神経変性疾患のリスクに及ぼす影響の評価 はじめに 近年、溶剤から農薬に至るまで、多くの環境化学物質が神経変性疾患の発症と進行に関係していると考えられています。しかしながら、これまでアルツハイマー病、パーキンソン病、その他の神経変性疾患に関連する数十の遺伝子を発見してきた全ゲノム関連研究のような体系的な方法は不足していました。幸いなことに、現在では数百から数千の化学的特性を暴露範囲で研究することができます。この新しい手法は、質量分析技術の進歩を利用して、ゲノムデータを補完する暴露データを生成し、神経変性疾患のより良い理解を可能にします。 寿命の延びに伴い、年齢に関連する神経変性疾患は、障害と死亡の主な原因となっています。最も一般的な2つの神経変性疾患であるアルツハイマー病(AD)とパ...