利用大规模微阵列进行可扩展的空间转录组学

利用大格式微阵列实现可扩展空间转录组学的新方法:Array-Seq技术的诞生 背景与研究起源 近年来,空间分子分析(spatiomolecular analyses)成为生物医学研究和临床病理学的重要工具,因为它能够研究组织中的细胞和分子空间位置如何影响其功能及其在健康和疾病中的异常变化。但现有的空间转录组学(spatial transcriptomics,ST)技术在多个层面面临制约:设备昂贵、操作复杂、表面积小、不支持大批量样本处理以及与常规组织学染色(如H&E染色)不兼容。这些缺点限制了技术的普及,也增大了其用于基础研究和临床分析的成本和难度。 早期的空间转录组学技术(如Visium平台)通过将空间条形码(spatial barcode)连接到捕获poly-A尾的寡聚核苷酸探针上实现了...

亚细胞分辨率的空间多组学高通量原位成对测序

亚细胞分辨率的空间多组学高通量原位成对测序

亚细胞分辨率的空间多组学高通量原位成对测序 研究背景和目的 随着生物医学研究的不断发展,多组学技术在细胞功能和疾病机制方面的应用越来越受到关注。然而,目前,许多原位测序方法仅限于解读一种生物分子类型的空间信息,同时多种生物分子(如DNA、RNA、蛋白质和小分子)原位共检测仍然面临挑战。此外,由于4n(4代表四种荧光染料,n代表测序或杂交轮数)解码能力的限制,高通量空间组学在成本和检测效率方面仍需改进。为了解决这些问题,本文报道了一种新型的高通量靶向原位测序方法——多组学原位配对测序(MIP-Seq),该方法能够高效检测大脑组织中多种生物分子,在分子和功能图谱的多维分析上提供了新的可能性。 论文来源 该研究由来自华中农业大学的Xiaofeng Wu, Weize Xu, Lulu Deng等人...