Apprentissage par cartographie contrastive pour la reconstruction spatiale des données de séquençage d'ARN unicellulaire

La technologie de séquençage d’ARN monocellulaire (scRNA-seq) permet une analyse transcriptomique à haut débit à la résolution d’une seule cellule, ce qui a considérablement fait progresser la recherche en biologie cellulaire. Cependant, une limitation notable de la technologie scRNA-seq est qu’elle nécessite la dissociation des tissus, ce qui entr...

Empreinte spatiotemporelle de la diversité des cellules T CD8 mémoire résidentes dans les tissus

Diversité spatiotemporelle des cellules T mémoire résidentes CD8 Contexte Les cellules T mémoire résidentes CD8 (Tissue-resident memory CD8 T cells, cellules TRM) fournissent une protection immunitaire à long terme au niveau des sites barrières, tels que l’intestin. Cependant, l’hétérogénéité des cellules TRM et les mécanismes de leur formation ne ...

Analyse avancée à cellule unique et spatiale avec caractérisation hautement multiplexée des cellules tumorales circulantes et du tissu tumoral dans le cancer de la prostate : Révélation des mécanismes de résistance avec l'essai CODuco in situ

Le cancer de la prostate (Prostate Cancer, PC) est la troisième tumeur solide la plus fréquemment diagnostiquée chez les hommes dans le monde, avec environ 1,4 million de nouveaux cas estimés en 2020. Avec le vieillissement de la population mondiale, l’incidence du cancer de la prostate devrait continuer à augmenter, atteignant potentiellement 2,9 ...

Analyse combinée de la transcriptomique unicellulaire et spatiale révèle l'hétérogénéité cellulaire de la voie Hedgehog dans le cancer gastrique

Analyse combinée de la transcriptomique unicellulaire et spatiale révèle l’hétérogénéité cellulaire de la voie Hedgehog dans le cancer gastrique Contexte académique Le cancer gastrique (Gastric Cancer, GC) est l’une des tumeurs malignes les plus courantes dans le monde, avec des taux d’incidence et de mortalité élevés. Malgré les progrès réalisés d...

Suivi in situ des lymphocytes T cibles liés aux inhibiteurs de points de contrôle chez les patients atteints de colite induite par les points de contrôle

Suivi in situ des lymphocytes T cibles liés aux inhibiteurs de points de contrôle chez les patients atteints de colite induite par les points de contrôle

Suivi des lymphocytes T cibles des inhibiteurs de points de contrôle in situ Contexte académique Les inhibiteurs de points de contrôle (Check Point Inhibitors, CPI) ont révolutionné le traitement du cancer en bloquant les signaux de régulation immunitaire médiés par les molécules de points de contrôle, rétablissant ainsi la fonction des lymphocytes...

Révélant des sous-populations de CAF associées au stress du réticulum endoplasmique lié à la progression du chordome

Révélant des sous-populations de CAF associées au stress du réticulum endoplasmique lié à la progression du chordome

Introduction Le chordome est une tumeur mésenchymateuse rare et localement invasive, supposée dériver de résidus des vestiges notochordaux primitifs. L’incidence du chordome est d’environ 0,8 cas par million d’habitants, avec une prédilection pour les régions sacrée et de la base du crâne. Actuellement, le traitement optimal consiste en une résecti...