SCICONE : Appel de nombre de copies et reconstruction de l'histoire des événements à cellule unique

Sciences de l'information, Informatique, Médecine, Oncologie, Sciences de la vie, Biologie cellulaire, Génie biologique, Génétique,
séquençage unicellulaire   variation du nombre de copies   évolution tumorale   modèle SCICONE   séquençage à faible profondeur  

Au cours du développement des tumeurs, les altérations du nombre de copies génomiques (Copy Number Alterations, CNAs) sont un facteur clé qui influence l’hétérogénéité et l’évolution tumorales. Comprendre ces variations est essentiel pour développer des méthodes de diagnostic et de traitement personnalisées du cancer. Le séquençage unicellulaire of...

Profilage transcriptomique à cellule unique du cœur révèle ANGPTL4 reliant les fibroblastes et l'angiogenèse dans l'insuffisance cardiaque avec fraction d'éjection préservée

Médecine, Système cardiovasculaire, Sciences de la vie, Biologie cellulaire,
insuffisance cardiaque   séquençage unicellulaire   ANGPTL4   métabolisme   angiogenèse  

Profil transcriptomique monocellulaire révélant la relation entre les fibroblastes cardiaques et l’angiogenèse : le rôle clé d’ANGPTL4 dans le HFpEF Contexte L’insuffisance cardiaque est l’un des principaux défis de santé à l’échelle mondiale. Elle se divise en deux catégories : l’insuffisance cardiaque avec fraction d’éjection préservée (heart fai...

Cartographie de l'espace génique à une résolution unicellulaire avec l'analyse des modèles de signaux géniques

Sciences de la vie, Biologie cellulaire, Génie biologique, Génétique,
séquençage unicellulaire   encastrement de gènes   traitement de signaux graphiques   bioinformatique   co-expression génique  

Cartographie de l’espace génique à résolution unicellulaire : étude sur l’analyse des motifs de signalisation génique (GSPA) Contexte académique La technologie de séquençage ARN unicellulaire (single-cell RNA sequencing, scRNA-seq) a fait des progrès significatifs ces dernières années dans la recherche biologique, notamment en révélant l’organisati...

Empreintes Multiscalaires Révélant l'Organisation des Éléments Cis-Régulateurs

Sciences de l'information, Intelligence artificielle, Sciences de la vie, Biologie cellulaire, Biochimie, Génie biologique, Génétique,
éléments cis-régulateurs   accessibilité de la chromatine   facteurs de transcription   apprentissage profond   séquençage unicellulaire   génomique   différenciation cellulaire  

Les empreintes multi-échelles révèlent le rôle des éléments cis-régulateurs dans la différenciation cellulaire et le vieillissement Contexte La régulation de l’expression génique est un mécanisme clé dans le destin cellulaire et la survenue de maladies, et les éléments cis-régulateurs (CREs) jouent un rôle essentiel dans ce processus. Les CREs régu...

Mosaïcisme complexe et cellules aneuploïdes dans le développement embryonnaire humain

Médecine, Obstétrique et gynécologie, Médecine fondamentale, Sciences de la vie, Biologie cellulaire, Biochimie, Génétique,
embryon humain   mosaïcisme   aneuploïdie   séquençage unicellulaire   développement embryonnaire  

Recherche sur le phénomène complexe de mosaïcisme dans les embryons humains : Révélation de l’aneuploïdie étendue au cours du développement embryonnaire précoce Contexte et objectifs de l’étude Le test génétique préimplantatoire pour l’aneuploïdie (PGT-A) est une technique largement utilisée dans les cycles de fécondation in vitro (FIV) pour amélio...