基于序列的功能宏基因组学揭示了环境微生物组中功能性COPA基因的新自然多样性 环境微生物组中的功能基因/蛋白质的自然多样性是进化和生物工程研究的重要组成部分。为了深入了解全球微生物中铜（Cu）抗性基因COPA的多样性，本研究采用了一种基于序列的功能宏基因组学方法。这项研究不仅将宏基因组组装技术、局部BLAST、进化迹分析（ETA）、化学合成和传统功能基因组学结合起来，还成功地高效挖掘了环境DNA（eDNA）中的COPA基因多样性。 研究背景 微生物进化过程中产生了多样的功能基因/蛋白质，这些基因/蛋白质在领域如微生物系统发育学和蛋白质工程中有着广泛的应用。例如，DNA指导的RNA聚合酶亚基Beta（RPB）和氮化酶铁蛋白（NIFH）等基因广泛用于识别和描述不可培养的‘黑暗物质’。现有已知功能...

美国一大型前瞻性队列研究揭示户外空气污染与成人血液系统癌症亚型之间的潜在联系 研究背景及目的 近年来，户外空气污染对人类健康的影响受到了广泛关注。国际癌症研究机构（IARC）自2013年起已将户外空气污染和细颗粒物（PM）列为1类人类致癌物，主要证据来源于肺癌研究。尽管目前的研究数据表明空气污染与血液癌症之间存在某种联系，但由于血液癌症在病理上的异质性，这类研究往往忽视了对癌症亚型的细致区分，导致相关结论尚缺乏明确和一致性。为了更深入地理解空气污染与各种血液癌症亚型间的关联，本研究选取了美国癌症协会的癌症预防研究II营养队列（American Cancer Society’s Cancer Prevention Study-II Nutrition Cohort），探讨居住地户外空气污染物与...

评估化学暴露对神经退行性疾病的风险 引言 近年来,从溶剂到农药,许多环境化学品被认为与神经退行性疾病的发展和进展有关。然而,迄今为止还缺乏一种类似于全基因组关联研究的系统方法,后者已经发现了与阿尔茨海默症、帕金森病和其他神经退行性疾病有关的数十个基因。幸运的是,现在可以在暴露组框架下研究数百到数千个化学特征。这种新兴的方法利用质谱技术的进步,可以产生暴露组数据来补充基因组数据,从而更好地理解神经退行性疾病。 随着人类寿命的延长,与年龄相关的神经退行性疾病已成为导致残疾和死亡的主要原因。最常见的两种神经退行性疾病阿尔茨海默病(AD)和帕金森病(PD)分别影响着全球超过4500万和600万人。尽管它们临床表现不同,但这些疾病在发病机制上存在共性,如错折蛋白质聚集、蛋白质降解系统中断、线粒体功能障...