单细胞与空间转录组联合分析揭示胃癌中Hedgehog通路的细胞异质性

单细胞与空间转录组联合分析揭示胃癌中Hedgehog通路的细胞异质性 学术背景 胃癌(Gastric Cancer, GC)是全球范围内最常见的恶性肿瘤之一,发病率和死亡率均居高不下。尽管在化疗、放疗和靶向治疗等方面取得了一定进展,但胃癌的治疗仍然面临巨大挑战。胃癌的侵袭性和异质性使其成为难治性癌症之一,尤其是晚期患者的生存率极低。肿瘤细胞的侵袭和转移是导致复发和死亡的主要原因,而现有的治疗手段无法完全解决这些问题。免疫治疗作为一种有前景的治疗模式,也面临着肿瘤微环境和免疫复杂性的挑战。因此,深入理解胃癌的发病机制,尤其是从基因、分子到表型水平的全面探索,对于更好地管理疾病和减轻患者负担至关重要。 Hedgehog(Hh)通路在胚胎发育和成人组织中均发挥重要作用,参与细胞增殖、分化和组织形态...

空间转录组时钟揭示细胞邻近效应对大脑衰老的影响

空间转录组时钟揭示脑衰老中的细胞邻近效应 学术背景 随着年龄的增长,认知功能下降和神经退行性疾病的风险显著增加。脑衰老是一个复杂的过程,伴随着许多细胞层面的变化。然而,衰老细胞如何影响邻近细胞以及这种影响如何导致组织功能衰退,目前尚不清楚。此外,现有的工具尚未能系统地解决衰老组织中的这一问题。为此,研究人员开发了一种空间分辨的单细胞转录组图谱,结合机器学习模型,揭示了衰老、再生和疾病中的空间和细胞类型特异性转录组特征。 论文来源 这篇论文由Eric D. Sun、Olivia Y. Zhou、Max Hauptschein、Nimrod Rappoport、Lucy Xu、Paloma Navarro Negredo、Ling Liu、Thomas A. Rando、James Zou和An...