在基因组编辑中,sacas9比spcas9具有优越的保真度和不同的编辑结果

高保真度和不同基因编辑结果的SaCas9与SpCas9比较 研究背景 基于Cas9蛋白的CRISPR系统已经成为基因组编辑的强大工具,并在基础研究和临床基因治疗中得到广泛应用。当前,最常用的Cas9变体是来自化脓链球菌(Streptococcus pyogenes)的SpCas9和来自金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)的SaCas9。尽管这两种Cas9蛋白在许多研究中得到了广泛验证,但具体的基因编辑效果比较仍然缺乏系统性研究。因此本文旨在系统比较SpCas9和SaCas9在基因编辑中的效率和精确度,并探讨其在不同剪切长度下的编辑性能。 研究来源 本文由来自中国医学科学院血液学研究所等几个研究机构的研究者们撰写,包括Zhi-Xue Yang、Ya-Wen Fu、Jia...

Tracking-Seq揭示CRISPR-Cas9介导基因组编辑中的脱靶效应异质性

转录组学技术跟踪序列(Tracking-Seq)揭示CRISPR-Cas9介导的基因组编辑的脱靶效应异质性 研究背景 随着基因组编辑技术的飞速发展,CRISPR-Cas9系统因其高效率、易操作而被广泛应用于生物医学研究领域。然而,由于CRISPR-Cas9系统进行DNA编辑时可能产生非靶效应,即在意图编辑以外的基因位点发生切割,因此如何对非靶效应进行全面识别和评估已成为科研中的一项重要课题。之前的研究主要采用细胞游离法等方法检测非靶效应,但这些方法往往存在对特定编辑工具或细胞类型的依赖性、需要大量细胞、假阳性率高以及仅限于体外基因组编辑等局限。鉴于此,开发一种通用的、能够在细胞原位直接检测非靶效应的方法显得十分迫切。另一方面,目前的研究也有所忽视编辑工具的靶向异质性,即不同编辑工具在不同细胞...