CRISPR依存スクリーニングによって原代造血幹細胞でIDH2およびTET2変異型の特異的感受性としてKDM3Bが同定された 背景と研究意義 クローン性造血（Clonal Hematopoiesis, CH）は、特定の変異を持つ造血幹細胞（Hematopoietic Stem Cell, HSC）によって引き起こされる遺伝子的に異なるサブ群細胞の異常な増殖を指す。この現象は60歳以上の人々の間で非常に一般的であり、20%以上の人口に影響を与える。CHは急性骨髄性白血病（AML）への悪性転化リスクの増加に関連し、さらに全原因の死亡率や心血管疾患などの年齢関連疾患とも関連している。以前の遺伝学研究はCHに関連する遺伝子変異を同定したが、CHにおける治療ターゲットを特定することは依然として困難であ...

双方向エピジェネティック編集が遺伝子制御の階層構造を明らかにする 背景と研究動機 ヒトゲノムにおいて、エンハンサーなどの非コード要素が遺伝子制御に果たす役割は広く認識されています。しかし、現在一般的に用いられているCRISPR干渉法は、非コード要素と遺伝的相互作用の研究においていくつかの限界があります。主に、従来のCRISPR手法、例えばCRISPR干渉（CRISPRi）やCRISPR活性化（CRISPRa）は、一度に単一の遺伝子座を編集することしかできないため、遺伝子制御ネットワークにおける相互作用の理解が制限されています。したがって、本研究はこれらの問題を解決するために、二方向のエピジェネティック特性を編集できるシステムを開発することを目指します。 出典と著者情報 この論文「Bidire...

乳がん細胞株のクロマチンアクセシビリティ解析による系統特異的なエピジェネティック制御因子FOXA1とGRHL2の同定 背景紹介 乳がんは非常に異質性の強い疾患であり、現在の臨床では遺伝子発現パターン、内在分子サブタイプ、ホルモン受容体/ヒト上皮成長因子受容体2 (HER2) の発現に基づいて分類されています。しかし、既存の研究は乳腺腫瘍が遺伝子発現以外にも明確な異質性を示していることを明らかにしています。例えば、エストロゲン受容体陽性(ER+)乳がんのいくつかはER応答エレメントのアクセシビリティが低下しており、予後不良を引き起こす可能性があります。これらの発見に基づいて、エピジェネティック状態の識別は乳がんの異質性をより包括的に理解するために重要です。 乳がん細胞株は乳がん研究の重要なモデ...

癌症和游离DNA中的全基因组重复序列全景 研究背景和意义 癌症及び他の病気の発展過程において、ゲノム内の繰り返し配列の遺伝的変化は重要な特徴の一つです。しかし、標準的なシーケンシング方法ではこれらの繰り返し配列を効果的に特徴づけることが難しいのです。この課題に対応するため、本研究ではArtemis（Analysis of Repeat Elements in Disease）と呼ばれる新しい方法を開発し、全ゲノムシーケンシング中の繰り返し要素を識別します。複数の癌患者の組織および血漿サンプルを分析することで、これらの繰り返し要素の具体的な変化を探索し、早期癌検出および病気のモニタリングにおける潜在的な応用価値を評価することを目的としています。 論文出典 本研究は、Akshaya V. Ann...