腫瘍の進化過程において、ゲノムコピー数変異（Copy Number Alterations, CNAs）は腫瘍の異質性と進化を駆動する重要な要因です。これらの変異を理解することは、個別化されたがん診断や治療法の開発にとって極めて重要です。単一細胞シーケンス技術は、単一細胞レベルまで深く分析できる最高解像度のコピー数解析を提供します。しかし、低リード深度（low read-depth）の全ゲノムシーケンスデータは、コピー数変異の検出に大きな統計的および計算上の課題をもたらします。既存の計算方法の多くは細胞間の進化的関係を無視しており、その結果、検出精度が低下しています。そのため、細胞の進化歴史を組み込んだコピー数検出方法の開発が現在の研究における緊急の課題となっています。 論文の出典 本論文は...

6224件の未解決の稀少疾患エクソームにおける構造変異検出と臨床解釈 研究背景 稀少疾患の診断と研究は、遺伝学と臨床医学における重要な課題です。構造変異（SVs）には、大きな欠失、重複、逆位、転座、さらに複雑なイベントが含まれ、これらはすべて遺伝子機能を破壊し、稀少疾患を引き起こす可能性があります。しかし、現在のエクソーム解析（ES）は、一塩基変異（SNVs）や50塩基対未満の挿入-欠失（indels）などの小さな体内変異の処理に関する分析ワークフローは確立していますが、SVsに関しては未だ成熟していません。本研究は、特にES データ内のSVを検出し解釈することで、未診断の稀少疾患症例を解決し、診断率を向上させることを目的としています。 研究出典 本研究はGerman Demidov、Ste...

本研究は、NR0B1 (DAX1)遺伝子のコピー数変異(CNVs)と46,XY性腺発育不全症との関係を探ることを目的としています。46,XY性腺発育不全症（gonadal dysgenesis, GD）は、性腺が完全に精巣に分化できないことによって引き起こされる性発達障害です。この疾患は、外性器が女性型または両性型の奇形を示すことがあります。以前は、この疾患はX染色体のXp21.2領域にあるNr0b1遺伝子の重複と関連していると考えられていましたが、最近の複雑な構造変異の研究では、Nr0b1遺伝子に直接関与しなくても同様の疾患が発生することが示されました。これは、Xp21.2領域のCNVsが46,XY性腺発育不全症を引き起こすメカニズムがまだ完全には理解されていないことを示しています。 論文...