本文介绍了一项关于胶质瘤患者预后的研究，该研究由Quanwei Zhou、Xuejun Yan、Youwei Guo、Xingjun Jiang、Tuo Cao和Yiquan Ke等作者共同完成，并于2024年发表在《npj Precision Oncology》期刊上。该研究的主要目标是探索肿瘤相关巨噬细胞（Tumor-Associated Macrophages, TAMs）在胶质瘤进展中的作用，特别是通过CD163+FPR3+巨噬细胞的特征来预测胶质瘤患者的预后。
胶质瘤是最常见的原发性恶性脑肿瘤，占所有中枢神经系统肿瘤的约30%。尽管手术、放疗和化疗等多种治疗手段被广泛应用，但胶质母细胞瘤（GBM）患者的中位生存期仅为14个月左右。胶质瘤的肿瘤微环境（Tumor Microenvironment, TME）具有高度的免疫抑制性和异质性，这极大地影响了肿瘤的恶性进展。TAMs在胶质瘤微环境中占据了约30%的肿瘤质量，并分为M1和M2两种表型。M1巨噬细胞与炎症反应相关，具有抗肿瘤活性，而M2巨噬细胞则通过分泌促血管生成因子和免疫抑制性细胞因子促进肿瘤生长。因此，理解TAMs在胶质瘤中的作用对于开发新的治疗策略至关重要。
研究首先通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析，识别出胶质瘤中的两种主要细胞类型：胶质瘤细胞和髓系细胞。通过加权基因共表达网络分析（Weighted Gene Co-expression Network Analysis, WGCNA），研究人员发现FPR3是TAMs相关模块中的枢纽基因，并且在CD163+巨噬细胞中表达。FPR3的表达与胶质瘤患者的临床预后相关，表明其在重塑胶质瘤微环境中可能发挥重要作用。
研究进一步鉴定了CD163+FPR3+巨噬细胞亚群，并利用10种机器学习算法构建了基于CD163+FPR3+巨噬细胞特征的预后模型。该模型在六个胶质瘤队列中进行了验证，结果显示其预测总体生存期的准确性优于传统的临床因素和100个已发表的预后标志物。
FPR3在CD163+巨噬细胞中的表达：通过单细胞RNA测序和免疫荧光染色，研究人员发现FPR3在CD163+巨噬细胞中显著表达，并且与M2样TAMs评分呈正相关。这表明FPR3可能是M2样TAMs的标志物。
FPR3的高表达与不良预后相关：在多个数据集中，FPR3的表达在胶质瘤组织中显著高于正常组织，并且在高级别胶质瘤中表达更高。FPR3的高表达与较短的总生存期（OS）和无进展生存期（PFS）显著相关，表明FPR3可能作为胶质瘤患者的预后标志物。
FPR3与免疫微环境的关系：通过基因集富集分析（Gene Set Enrichment Analysis, GSEA），研究人员发现FPR3高表达的胶质瘤中免疫调节通路显著富集。此外，FPR3高表达的胶质瘤表现出更高的免疫和基质评分，表明FPR3可能在调节免疫和基质细胞中发挥作用。
CD163+FPR3+巨噬细胞亚群的鉴定：研究人员通过聚类分析鉴定了11个不同的髓系细胞簇，并进一步将巨噬细胞分为CD163+FPR3+和CD163+FPR3−两组。CD163+FPR3+巨噬细胞的特征基因主要富集在IL6-JAK-STAT3信号通路、炎症反应和TNFA信号通路等。
预后模型的开发与验证：通过机器学习算法，研究人员构建了一个基于CD163+FPR3+巨噬细胞特征的预后模型。该模型在多个数据集中表现出较高的预测准确性，并且优于其他已发表的预后标志物。
该研究成功鉴定了CD163+FPR3+巨噬细胞亚群，并通过机器学习算法构建了一个能够预测胶质瘤患者预后和治疗反应的模型。该模型在多个数据集中表现出较高的预测准确性，表明其具有潜在的临床应用价值。此外，FPR3的高表达与不良预后相关，提示其可能作为胶质瘤患者的预后标志物和治疗靶点。
研究还探讨了FPR3在免疫检查点调控中的作用，发现FPR3高表达的胶质瘤中PD-L1、PD-1和CD40等免疫检查点的表达显著增加，这为胶质瘤的免疫治疗提供了新的潜在靶点。
总之，该研究通过深入分析胶质瘤微环境中的巨噬细胞亚群，揭示了FPR3在胶质瘤进展和预后中的重要作用，并为胶质瘤的个体化治疗提供了新的工具和思路。