大腸組織生検における高感度メタゲノムシーケンシング：宿主DNAの除去の影響 背景 次世代シーケンシング技術を用いて培養条件なしでバクテリアの分類構造を評価することは、細菌の不均衡とさまざまな疾患との関係を研究するための一般的な方法となっています。これまでの研究では、16S rRNA遺伝子アンプリコンまたはメタゲノムシーケンシングを用いて、ヒトの口腔、腸粘膜、糞便サンプルの微生物叢スペクトルを分析してきました。しかし、16S rRNA遺伝子シーケンシングは分類識別の解像度に限界があるのに対し、メタゲノムシーケンシングは種や亜種レベルのバクテリアを識別することができます。さらに、メタゲノムシーケンシングは複数の領域にわたるデータを提供し、複数のドメインにまたがる相互作用を推測することができます。...

概述 Communications Biologyに「supervised latent factor modeling isolates cell-type-specific transcriptomic modules that underlie Alzheimer’s disease progression」という論文が発表されました。本論文は、Liam Hodgson、Yue Li、Yasser Iturria-Medina、Jo Anne Stratton、Guy Wolf、Smita Krishnaswamy、David A. BennettおよびDanilo Bzdokら、McGill大学、モントリオール大学、イェール大学とラッシュ大学医療センターなどの研究者によって共同執筆さ...

小児髄芽腫における一次治療後の持続性MRI病変の反応は、予後リスクを予測する代替指標となる可能性がある 髄芽腫は、小児の最も一般的な悪性中枢神経系腫瘍の1つですが、集学的治療概念の導入により患者の予後は大幅に改善されました。しかし、一部の患者では予後が依然として不良です。一次治療後に持続する残存病変(局所の残存腫瘍、持続する転移病巣、または不確かな成分の病変)が予後にどのような影響を与えるかは現時点では不明確です。そこで本研究は、持続する残存病変が予後に及ぼす影響を評価し、このような患者の生存に影響を与える危険因子を分析し、その上で診断作業と治療方針の総合的評価を行うことを目的としています。 研究の発表元 本研究は、Denise Obrecht-Sturm氏らドイツ、スイス、オーストリアの複...