这项研究运用机器学习框架探索了构成软组织肉瘤的基础细胞状态及其细胞生态系统,并将其与患者预后及免疫疗法反应性进行了关联分析。 研究背景:软组织肉瘤是一种罕见且异质性强的结缔组织恶性肿瘤,目前对转移期患者的系统治疗选择有限。虽然最近的研究显示免疫检查点抑制剂(ICI)可以使部分转移期肉瘤患者获得持久缓解,但大多数患者并不能从中获益。传统的生物标志物(如肿瘤突变负荷和PD-L1表达)无法准确预测肉瘤患者对ICI的反应。研究人员推测,独特的肿瘤微环境可能是导致这一现象的关键因素。 研究过程:研究人员组建了一个299例局部期肉瘤患者的RNA-seq表达谱训练队列,以及一个310例局部期肉瘤患者的基因芯片数据验证队列,并结合相关临床注释信息。他们运用Ecotyper机器学习框架,从肉瘤的bulk转录组...

免疫治疗驱动胶质母细胞瘤中的间质肿瘤细胞状态转变和肿瘤微环境免疫反应 引言 胶质母细胞瘤是一种高度恶性的脑肿瘤,目前尚无根治性治疗方案。虽然免疫治疗在其他癌症类型中取得了一定疗效,但在胶质母细胞瘤患者中的反应有限。采用单细胞分辨率深入研究免疫治疗对肿瘤细胞和肿瘤微环境的影响,有助于认识治疗耐药的潜在机制,并设计新的治疗策略。 论文来源 本研究由约阿希姆·魏申费尔德(Joachim Weischenfeldt)等人完成,他们分别来自丹麦哥本哈根大学附属医院及生物技术研究与创新中心、丹麦综合癌症中心脑肿瘤中心等单位。该研究结果发表于《神经肿瘤学》(Neuro-Oncology)杂志的在线预印本版本。 研究方法和结果 研究对象及工作流程 研究对象是参加一项nivolumab(PD-1抑制剂)免疫检...