高通量宏基因组测序在结肠组织活检中的高灵敏度：去除宿主DNA的影响 背景 在无培养条件下通过下一代测序技术评估细菌分类结构，已成为研究细菌失衡与各种疾病关系的常用方法。已有研究通过16S rRNA基因扩增子或宏基因组测序分析了人类口腔、肠道粘膜和粪便样本的微生物群落谱。然而，16S rRNA基因测序在分类识别的分辨率方面存在局限性，而宏基因组测序能够识别到种甚至亚种水平的细菌。此外，宏基因组测序还可提供多界数据，推测跨多个领域的相互作用。 虽然宏基因组测序在表征组织样本中的微生物群落方面具有重要的临床应用，包括疾病的诊断和治疗，但样本中的人类DNA占多数，限制了低丰度细菌的检测。这种DNA丰度的不平衡导致组织样本中宏基因组测序灵敏度降低。因此，为解决这一问题，研究人员提出了一种优化的方法，通...

通过进食时间调整肠道昼夜节律缓解胃肠道炎症的研究 背景资讯 肠道昼夜节律基因表达在炎症性肠病（IBD）患者的活检中已被观察到受损。昼夜节律的破坏，如在轮班工人中发生的那样，已被证明与胃肠道疾病，包括IBD的风险增加有关。具体到肠道，上皮细胞中的昼夜节律钟被认为通过调节微生物组来平衡胃肠道的稳态。然而，肠道昼夜节律在IBD中的作用尚未完全揭示。 最近的研究表明，通过限定时间的进食能够改善代谢健康和炎症，并影响肠道微生物群。因此，研究团队假设通过进食时间调整肠道昼夜节律有望影响IBD的发展和进程。 论文来源 此项研究由Technical University of Munich和University of Surrey的研究人员合作完成，包括Yunhui Niu、Marjolein Heddes...

TREM2缺陷重塑肠道巨噬细胞与微生物群 以增强抗PD-1肿瘤免疫治疗 华盛顿大学医学院的研究团队，由Blanda Di Luccia等多名科学家领衔，日前在《Science Immunology》杂志上发表了一项研究论文，揭示了肠道微生物群及肿瘤相关巨噬细胞如何影响抗PD-1免疫检查点阻断治疗的研究成果。研究证实，通过阻断或删除巨噬细胞上的触发性受体TREM2，能够增强机体抗肿瘤T细胞应答，并揭示了TREM2缺陷小鼠在抗PD-1治疗后，肠道巨噬细胞向促炎状态的转变，及肠道微生物群中鲁米诺考古菌（Ruminococcus gnavus）的扩展。 研究背景 免疫检查点抑制剂（CPIs）通过阻断PD-1、PD-L1和CTLA-4等蛋白质已在治疗多种癌症中取得成功，但尚有相当数量的患者未能持久响应...

TREM2缺陷重编程肠道巨噬细胞和微生物群以增强抗PD-1肿瘤免疫疗法 背景介绍 免疫检查点抑制剂（CPIs），如阻断程序性细胞死亡蛋白-1（PD-1）、程序性死亡配体-1（PD-L1）和细胞毒性T淋巴细胞相关抗原-4（CTLA-4）的药物已被成功用于激活抗肿瘤T细胞反应，以治疗多种类型的癌症。然而，尽管许多患者对CPIs表现出持久反应，但仍有大量患者对治疗无反应或出现复发，促使科学家们探索改善CPIs疗效的互补治疗途径。肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）支持肿瘤细胞的存活、增殖和血管生成，并抑制免疫反应，从而削弱了CPIs的疗效。阻断或删除在TAMs上广泛表达的巨噬细胞受体触发受体-2（TREM2）能减弱TAMs的免疫抑制功能并增强抗PD-1诱导的抗肿瘤T细胞反应。 另一种提高CPI治疗效果的策...