MECP2重复综合征的结构变异等位基因异质性及其对临床严重性和疾病表达变异性的影响

MECP2 重复综合征中的结构变异与表型变异性研究报道 学术背景 MECP2 重复综合征(MECP2 Duplication Syndrome,MRXSL)是一种 X 连锁基因组疾病,主要由 X 染色体上 MECP2 基因的拷贝数增加所致。这种疾病主要影响男性,临床特征多样,包括婴儿低张力、严重的发育迟缓、智力残疾、语言能力丧失、渐进性痉挛性瘫痪、胃肠问题、频繁的呼吸道感染和癫痫。虽然 MRXSL 病例表现出显著的临床多样性,但目前尚不清楚基因组结构变异与临床表型之间的具体联系。此外,复杂基因组重排(Complex Genomic Rearrangements, CGRs)在高达 38% 的 MRXSL 家庭中被发现,这进一步加深了对该疾病的复杂性认知。鉴于此,研究者希望通过综合基因组学、转...

6224个未解决的罕见疾病外显子测序中的结构变异检测和临床解释

结构变异检测及在6224个未解决的罕见病外显子中的临床解释 研究背景 罕见病的诊断与研究一直是遗传学和临床医学的重要挑战。结构变异(SVs),包括大片段缺失、重复、倒位、易位以及更复杂的事件,均可能破坏基因功能,导致罕见疾病。然而,目前的外显子测序(ES)在处理小体内变异如单核苷酸变异(SNVs)和短于50个碱基对的插入-缺失(indels)方面的分析流程,对于SVs则尚不成熟。本研究旨在提高诊断率,尤其是通过检测和解释ES数据中的SV来解决尚未诊断出的罕见病病例。 研究来源 本研究由German Demidov, Steven Laurie等人联合完成,涉及来自不同研究机构的专家学者共同努力。文章发表于2024年在《European Journal of Human Genetics》上,...

39 kb 结构变异导致林奇综合征的光学基因组测序和纳米孔测序检测

采用光学基因组测序与纳米孔测序技术检测出致使林奇综合征的39 kb结构变异 研究背景 林奇综合征(Lynch Syndrome, LS)是一种遗传性癌症综合征,主要由MMR(错配修复)基因家族中的四个基因MLH1、MSH2、MSH6和PMS2的致病性生殖系变异所引起。该综合征以显著增加患多种癌症类型的风险为特征,尤其是结直肠癌和子宫内膜癌,并表现为常染色体显性遗传。早期检测和癌症预防在已知变异的情况下成为可能,因此精确和灵敏的遗传测试方法非常重要。本研究旨在发现标准遗传测试未能确认的LS的潜在致病变异。 文章来源 本文由Pål Marius Bjørnstad、Ragnhild Aaløkken等人编写,这些作者来自奥斯陆大学医院、挪威科技大学、St. Olavs Hospital等研究机构...

癌症和游离DNA中的全基因组重复序列全景

癌症和游离DNA中的全基因组重复序列全景

癌症和游离DNA中的全基因组重复序列全景 研究背景和意义 在癌症及其他疾病的发展过程中,基因组中重复序列的遗传变化是一个重要特征。然而,标准的测序方法难以有效地表征这些重复序列。为了应对这一挑战,该研究开发了一种新的方法,称为Artemis(Analysis of Repeat Elements in Disease),用于识别全基因组测序中的重复元素。通过分析多种癌症患者的组织和血浆样本,旨在探索这些重复元素的具体变化,并评估其对早期癌症检测和疾病监测的潜在应用价值。 论文来源 本研究由Akshaya V. Annapragada、Noushin Niknafs、James R. White等人共同完成,他们隶属于约翰·霍普金斯大学医学院Sidney Kimmel综合癌症中心和医学系。该成...